24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_C0003 on replicon NC_009787
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  37.09 
 
 		 940 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  100 
 
 		 960 aa  1975    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  38.21 
 
 		 1051 aa  572  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  27.81 
 
 		 935 aa  332  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  27.18 
 
 		 939 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  26.16 
 
 		 937 aa  258  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  26.16 
 
 		 937 aa  258  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  24.87 
 
 		 937 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  26.24 
 
 		 919 aa  255  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  25.13 
 
 		 936 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  24.85 
 
 		 942 aa  250  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  27.53 
 
 		 931 aa  248  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  25.14 
 
 		 900 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  23.74 
 
 		 938 aa  170  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  24.11 
 
 		 1313 aa  132  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1136 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  25.85 
 
 		 923 aa  124  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  25.36 
 
 		 924 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  24.09 
 
 		 1015 aa  118  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  26.28 
 
 		 923 aa  112  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1093 aa  66.6  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0189  type IV conjugative transfer system protein TraG  22.73 
 
 		 1204 aa  53.5  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111366 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  21.14 
 
 		 922 aa  49.7  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4272  hypothetical protein  21.24 
 
 		 1776 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>