26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2664 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  89.06 
 
 		 923 aa  1566    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  100 
 
 		 924 aa  1878    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  77.27 
 
 		 923 aa  1407    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  29.76 
 
 		 1015 aa  195  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  27.37 
 
 		 900 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  26.75 
 
 		 1313 aa  170  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  28.09 
 
 		 938 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1136 aa  159  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  26.28 
 
 		 960 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  23.21 
 
 		 1051 aa  134  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  23.68 
 
 		 935 aa  133  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  22.88 
 
 		 931 aa  123  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  23.52 
 
 		 940 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  23.68 
 
 		 919 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  22.49 
 
 		 939 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  22.12 
 
 		 937 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  22.12 
 
 		 937 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  21.05 
 
 		 936 aa  94.7  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  21.29 
 
 		 942 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  21.08 
 
 		 937 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0189  type IV conjugative transfer system protein TraG  23.82 
 
 		 1204 aa  73.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1594  sex pilus assembly  23.22 
 
 		 1145 aa  68.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1093 aa  63.9  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  30.53 
 
 		 922 aa  62.4  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1107  TraG-like protein  28.95 
 
 		 529 aa  54.7  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  73.21 
 
 		 381 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>