22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_18 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  100 
 
 		 931 aa  1927    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  42.73 
 
 		 939 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  42.23 
 
 		 937 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  42.23 
 
 		 937 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  42.42 
 
 		 942 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  42.42 
 
 		 936 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  41.32 
 
 		 937 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  31.49 
 
 		 1051 aa  266  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  28.69 
 
 		 940 aa  261  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  27.83 
 
 		 960 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  26.71 
 
 		 935 aa  242  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  23.59 
 
 		 919 aa  193  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  25.49 
 
 		 900 aa  184  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  23.21 
 
 		 938 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1136 aa  128  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  25.59 
 
 		 1015 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  25.65 
 
 		 1313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  23.54 
 
 		 923 aa  112  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  23.34 
 
 		 923 aa  110  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  24.81 
 
 		 924 aa  107  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  23.17 
 
 		 922 aa  49.7  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1107  TraG-like protein  25.64 
 
 		 529 aa  47.8  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>