22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4427 on replicon NC_011668
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  100 
 
 		 937 aa  1950    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  97.24 
 
 		 942 aa  1876    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  89.01 
 
 		 937 aa  1728    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  84.13 
 
 		 939 aa  1620    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  89.01 
 
 		 937 aa  1728    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  97.44 
 
 		 936 aa  1876    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  41.32 
 
 		 931 aa  589  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  28.15 
 
 		 940 aa  272  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  27.72 
 
 		 935 aa  270  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  27.69 
 
 		 1051 aa  263  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  24.42 
 
 		 960 aa  249  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  25.93 
 
 		 919 aa  216  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  24.91 
 
 		 900 aa  167  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1136 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  22.94 
 
 		 938 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  25.22 
 
 		 1313 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  24.85 
 
 		 1015 aa  108  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  22.4 
 
 		 923 aa  98.6  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  21.89 
 
 		 923 aa  71.2  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  21.89 
 
 		 924 aa  70.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  21.35 
 
 		 922 aa  57.4  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  21.22 
 
 		 1093 aa  48.5  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>