25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6815 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  100 
 
 		 1313 aa  2665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  34.78 
 
 		 1015 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  27.47 
 
 		 923 aa  157  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  27.29 
 
 		 924 aa  154  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  25.08 
 
 		 940 aa  148  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  27.08 
 
 		 923 aa  147  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  24.54 
 
 		 960 aa  139  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  25.52 
 
 		 935 aa  139  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  24.61 
 
 		 1051 aa  131  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  25.32 
 
 		 939 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  25 
 
 		 942 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  24.93 
 
 		 937 aa  125  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  24.78 
 
 		 936 aa  124  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  24.47 
 
 		 937 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  24.47 
 
 		 937 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  25.65 
 
 		 931 aa  116  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  23.16 
 
 		 900 aa  112  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  21.22 
 
 		 1136 aa  89.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  21.43 
 
 		 938 aa  77.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  21.87 
 
 		 919 aa  69.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0376  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1172 aa  63.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  22.09 
 
 		 922 aa  61.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1107  TraG-like protein  21.45 
 
 		 529 aa  54.3  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0189  type IV conjugative transfer system protein TraG  21.06 
 
 		 1204 aa  48.9  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111366 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1093 aa  48.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>