18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1107 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1107  TraG-like protein  100 
 
 
529 aa  1083    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  87.33 
 
 
922 aa  936    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0952  hypothetical protein  94.89 
 
 
371 aa  649    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.135953  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  31.03 
 
 
1093 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0950  hypothetical protein  80.91 
 
 
174 aa  169  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.388203  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0951  hypothetical protein  97.37 
 
 
40 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.621371  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  24.37 
 
 
940 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  20.91 
 
 
938 aa  57.4  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  22.83 
 
 
1051 aa  54.3  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  21.07 
 
 
1313 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0243  hypothetical protein  21.71 
 
 
1199 aa  50.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  28.57 
 
 
923 aa  50.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  20.45 
 
 
919 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  27.89 
 
 
924 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  27.89 
 
 
923 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  21.97 
 
 
935 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  20.67 
 
 
900 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  25.64 
 
 
931 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>