24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4304 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  100 
 
 
1051 aa  2162    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  38.08 
 
 
940 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  37.87 
 
 
960 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  27.96 
 
 
935 aa  283  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  28.59 
 
 
939 aa  282  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  28.4 
 
 
937 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  28.4 
 
 
937 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  31.49 
 
 
931 aa  266  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  27.96 
 
 
942 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  27.69 
 
 
937 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  27.73 
 
 
936 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  26.64 
 
 
919 aa  223  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  24.55 
 
 
938 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  26.38 
 
 
900 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  23.53 
 
 
1136 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  24.61 
 
 
1313 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  24.51 
 
 
923 aa  122  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  23.01 
 
 
923 aa  122  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  22.68 
 
 
1015 aa  121  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  23.01 
 
 
924 aa  120  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  23.91 
 
 
922 aa  58.9  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  22.31 
 
 
1093 aa  55.1  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1107  TraG-like protein  22.83 
 
 
529 aa  54.3  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0189  type IV conjugative transfer system protein TraG  20.65 
 
 
1204 aa  45.8  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000111366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>