26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2169 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  100 
 
 		 900 aa  1830    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  42.12 
 
 		 938 aa  630  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1136 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  26.67 
 
 		 935 aa  216  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  26.36 
 
 		 931 aa  191  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  25.03 
 
 		 942 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  25.33 
 
 		 937 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  25.55 
 
 		 936 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  26.43 
 
 		 960 aa  172  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  24.43 
 
 		 937 aa  171  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  24.43 
 
 		 937 aa  171  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  24.73 
 
 		 939 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  27.25 
 
 		 940 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  25.44 
 
 		 1051 aa  156  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  26.89 
 
 		 923 aa  151  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  26.68 
 
 		 924 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  22.67 
 
 		 919 aa  135  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  28.09 
 
 		 923 aa  134  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  26.04 
 
 		 1015 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  23.16 
 
 		 1313 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  22.81 
 
 		 922 aa  68.9  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0243  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1199 aa  67  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0305  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1205 aa  65.1  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1093 aa  52.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0189  type IV conjugative transfer system protein TraG  18.87 
 
 		 1204 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111366 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1107  TraG-like protein  20.67 
 
 		 529 aa  48.1  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>