27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0805 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  100 
 
 		 1093 aa  2241    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  27.37 
 
 		 922 aa  201  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1107  TraG-like protein  30.85 
 
 		 529 aa  183  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0952  hypothetical protein  28.65 
 
 		 371 aa  135  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.135953  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  25 
 
 		 940 aa  102  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  21.97 
 
 		 919 aa  100  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  22.86 
 
 		 935 aa  94  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1136 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  20.41 
 
 		 939 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  22.44 
 
 		 960 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0189  type IV conjugative transfer system protein TraG  23.57 
 
 		 1204 aa  69.7  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  23.2 
 
 		 923 aa  69.7  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  23.57 
 
 		 1051 aa  68.9  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  21.45 
 
 		 942 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  20.67 
 
 		 936 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  23.2 
 
 		 924 aa  68.2  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  21.31 
 
 		 937 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  20.3 
 
 		 937 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  20.3 
 
 		 937 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  22.61 
 
 		 900 aa  62.4  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  20.39 
 
 		 938 aa  61.6  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  21.72 
 
 		 1313 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  24.49 
 
 		 923 aa  54.3  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  20.96 
 
 		 1015 aa  49.7  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0243  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1199 aa  49.7  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1594  sex pilus assembly  22.42 
 
 		 1145 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0305  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1205 aa  46.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>