26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0037 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  100 
 
 		 919 aa  1903    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  24.92 
 
 		 940 aa  248  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  25.98 
 
 		 960 aa  248  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  25 
 
 		 935 aa  238  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  26.35 
 
 		 939 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  26.86 
 
 		 1051 aa  226  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  25.72 
 
 		 937 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  25.57 
 
 		 937 aa  218  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  25.57 
 
 		 937 aa  218  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  26.11 
 
 		 942 aa  217  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  25.6 
 
 		 936 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  23.59 
 
 		 931 aa  197  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  26 
 
 		 938 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1136 aa  144  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  23.23 
 
 		 900 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  22.39 
 
 		 1015 aa  111  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  26.41 
 
 		 923 aa  97.4  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  26.47 
 
 		 924 aa  95.9  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1093 aa  94.4  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0189  type IV conjugative transfer system protein TraG  24.31 
 
 		 1204 aa  92.8  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  24.69 
 
 		 923 aa  89.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1594  sex pilus assembly  25 
 
 		 1145 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  21.19 
 
 		 1313 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  20.75 
 
 		 922 aa  58.9  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1107  TraG-like protein  20.95 
 
 		 529 aa  51.6  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0376  hypothetical protein  21.27 
 
 		 1172 aa  46.2  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>