27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5383 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  100 
 
 		 938 aa  1924    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  42.11 
 
 		 900 aa  634  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1136 aa  208  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  25.35 
 
 		 940 aa  180  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  25 
 
 		 935 aa  178  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  23.84 
 
 		 931 aa  171  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  24.67 
 
 		 1051 aa  167  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  23.8 
 
 		 960 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  23.5 
 
 		 937 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  23.82 
 
 		 937 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  23.82 
 
 		 937 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  24.01 
 
 		 942 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  24.01 
 
 		 936 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  26.78 
 
 		 923 aa  152  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  28.44 
 
 		 924 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  24.55 
 
 		 939 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  25.14 
 
 		 919 aa  146  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  28.17 
 
 		 923 aa  139  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  24.68 
 
 		 1015 aa  99.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  21.43 
 
 		 1313 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0243  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1199 aa  71.6  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0305  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1205 aa  66.6  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  23.2 
 
 		 922 aa  61.2  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1107  TraG-like protein  20.91 
 
 		 529 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0189  type IV conjugative transfer system protein TraG  19.77 
 
 		 1204 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111366 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  20.66 
 
 		 1093 aa  55.8  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1594  sex pilus assembly  21.51 
 
 		 1145 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>