267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2840 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  75.79 
 
 		 755 aa  1015    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  64.76 
 
 		 762 aa  845    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  63.95 
 
 		 778 aa  845    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  85.29 
 
 		 764 aa  1172    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  69.97 
 
 		 774 aa  910    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 		 764 aa  1483    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1711  ComEC/Rec2-related protein  72.13 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  41.65 
 
 		 757 aa  442  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  38.63 
 
 		 792 aa  386  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  43.23 
 
 		 738 aa  382  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4682  ComEC/Rec2-related protein  39.95 
 
 		 752 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5147  ComEC/Rec2-related protein  39.95 
 
 		 752 aa  362  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  36.85 
 
 		 718 aa  342  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  39.73 
 
 		 753 aa  339  9e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1679  ComEC/Rec2-related protein  36.16 
 
 		 779 aa  335  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  39.22 
 
 		 760 aa  317  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  35.63 
 
 		 672 aa  313  5.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  36.49 
 
 		 739 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1522  ComEC/Rec2-related protein  41.93 
 
 		 736 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302052  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  35.88 
 
 		 671 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  35.67 
 
 		 799 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  36.27 
 
 		 684 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  36.27 
 
 		 684 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  33.14 
 
 		 858 aa  280  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  34.08 
 
 		 810 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  31.66 
 
 		 757 aa  271  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  26.19 
 
 		 720 aa  270  8.999999999999999e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  27.95 
 
 		 674 aa  270  1e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  33.33 
 
 		 706 aa  269  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1644  ComEC/Rec2-related protein  35.08 
 
 		 788 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  38.4 
 
 		 754 aa  267  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  33.89 
 
 		 843 aa  262  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  34.06 
 
 		 694 aa  259  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  35.71 
 
 		 726 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  34.6 
 
 		 719 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  34.38 
 
 		 717 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  34.31 
 
 		 697 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  34.37 
 
 		 702 aa  236  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  29.22 
 
 		 672 aa  234  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1007 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  34.83 
 
 		 714 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  32.18 
 
 		 760 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  24.34 
 
 		 736 aa  188  3e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  34.46 
 
 		 695 aa  178  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.66 
 
 		 815 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.94 
 
 		 797 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.37 
 
 		 771 aa  125  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.08 
 
 		 784 aa  118  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.92 
 
 		 808 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.75 
 
 		 798 aa  114  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.84 
 
 		 811 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.56 
 
 		 777 aa  114  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.9 
 
 		 818 aa  112  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.14 
 
 		 794 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.35 
 
 		 841 aa  107  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  30.34 
 
 		 825 aa  107  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.95 
 
 		 770 aa  107  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.35 
 
 		 785 aa  103  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.14 
 
 		 778 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.84 
 
 		 840 aa  101  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.68 
 
 		 801 aa  99  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.65 
 
 		 757 aa  98.2  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.05 
 
 		 773 aa  97.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.06 
 
 		 791 aa  96.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.04 
 
 		 845 aa  97.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1202  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.02 
 
 		 776 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.177641 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.05 
 
 		 840 aa  95.9  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.57 
 
 		 822 aa  93.2  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.04 
 
 		 773 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1437  ComEC/Rec2-related protein  30.53 
 
 		 750 aa  93.2  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.09 
 
 		 747 aa  92.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.5 
 
 		 761 aa  92  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  26.44 
 
 		 593 aa  90.9  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  22.26 
 
 		 679 aa  90.1  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  27.35 
 
 		 689 aa  90.5  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.72 
 
 		 878 aa  90.5  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.09 
 
 		 860 aa  89.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.05 
 
 		 780 aa  87.8  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.01 
 
 		 802 aa  87.8  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.5 
 
 		 814 aa  87.8  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.54 
 
 		 799 aa  87  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.11 
 
 		 835 aa  86.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  25.75 
 
 		 708 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 		 851 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.5 
 
 		 861 aa  85.1  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1632  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.06 
 
 		 738 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.32 
 
 		 773 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1806  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.92 
 
 		 804 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.64 
 
 		 860 aa  83.2  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3848  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.27 
 
 		 738 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.86 
 
 		 800 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.69 
 
 		 766 aa  81.6  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.82 
 
 		 948 aa  81.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.13 
 
 		 786 aa  81.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  24.65 
 
 		 773 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  23.82 
 
 		 735 aa  80.1  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.31 
 
 		 840 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  26.82 
 
 		 847 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  23.85 
 
 		 735 aa  80.1  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  26.27 
 
 		 801 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>