More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2793 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 341 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  88.86 
 
 		 341 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  83.58 
 
 		 341 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  78.89 
 
 		 342 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  80.18 
 
 		 341 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  78.7 
 
 		 342 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  79.58 
 
 		 338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.35 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  62.42 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.19 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.66 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.49 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  60.6 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.63 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.42 
 
 		 337 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.43 
 
 		 337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.76 
 
 		 341 aa  345  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  56.01 
 
 		 343 aa  342  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.43 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.58 
 
 		 341 aa  338  8e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.6 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.2 
 
 		 339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  51.81 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  52.11 
 
 		 337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  55.22 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.09 
 
 		 339 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.31 
 
 		 335 aa  295  7e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  48.18 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.7 
 
 		 308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.05 
 
 		 355 aa  268  8e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.23 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.48 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.05 
 
 		 338 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.6 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  53.69 
 
 		 337 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.48 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.1 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.71 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.53 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.13 
 
 		 308 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.51 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.22 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.46 
 
 		 348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.92 
 
 		 363 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  35.57 
 
 		 341 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  35.23 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.57 
 
 		 341 aa  159  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.74 
 
 		 511 aa  159  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  35.23 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  35.23 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  35.23 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  36.52 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  35.23 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  35.23 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  35.23 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.06 
 
 		 362 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  37.63 
 
 		 347 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  36.17 
 
 		 381 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  33.63 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  32.51 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.57 
 
 		 347 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  33.57 
 
 		 517 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  33.89 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  33.89 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  33.89 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  33.89 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  32.83 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  33.89 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.47 
 
 		 528 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  35.44 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  34.81 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  34.81 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  34.81 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  34.81 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  34.81 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  34.81 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  34.81 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  33.87 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  33.89 
 
 		 339 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  34.74 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.15 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  35.82 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.45 
 
 		 511 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  35.44 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  34.97 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  34.39 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  35.61 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  31.31 
 
 		 331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  32.86 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  34.39 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.64 
 
 		 478 aa  145  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  35.97 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  33.67 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  31.9 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  33.02 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  37.5 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  35.25 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  33.94 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  35.25 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>