More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1447 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1012  Signal transduction histidine kinase  53.49 
 
 
1005 aa  810    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.948548  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  73.42 
 
 
1149 aa  1669    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1447  histidine kinase A-like  100 
 
 
1201 aa  2391    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.88 
 
 
1031 aa  856    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.75 
 
 
981 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0915227  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4618  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  61.92 
 
 
1191 aa  1338    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  33.94 
 
 
1035 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  33.94 
 
 
1035 aa  446  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
1138 aa  445  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.74 
 
 
1192 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  41.01 
 
 
1410 aa  379  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  63.9 
 
 
1188 aa  364  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478025  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
1296 aa  362  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
1276 aa  357  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
836 aa  355  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
969 aa  350  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.45 
 
 
728 aa  342  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
1000 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2561  PAS sensor protein  31.23 
 
 
846 aa  273  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218837  normal  0.950665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2784  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
841 aa  272  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.759601  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
853 aa  259  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
846 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0595123  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
911 aa  169  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
511 aa  159  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
717 aa  157  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  36.23 
 
 
503 aa  155  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  30.41 
 
 
773 aa  155  5.9999999999999996e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
798 aa  154  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
530 aa  154  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
513 aa  154  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
513 aa  153  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  35.18 
 
 
513 aa  153  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
371 aa  153  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
512 aa  152  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  37.23 
 
 
511 aa  152  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
778 aa  151  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  36.36 
 
 
532 aa  151  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  35.18 
 
 
513 aa  151  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  35.18 
 
 
513 aa  151  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
518 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
533 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
536 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
511 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 
697 aa  149  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
530 aa  148  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
773 aa  148  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
1041 aa  148  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
511 aa  148  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
531 aa  148  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  35.5 
 
 
511 aa  148  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
785 aa  148  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
1069 aa  147  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
1369 aa  147  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
661 aa  147  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
536 aa  146  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
468 aa  145  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
594 aa  145  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  26.41 
 
 
1255 aa  144  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
587 aa  144  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
523 aa  144  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
844 aa  144  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  26.11 
 
 
823 aa  144  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 
1548 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
509 aa  143  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
784 aa  142  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
470 aa  141  6e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  31.64 
 
 
470 aa  141  7e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
484 aa  141  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
389 aa  140  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
617 aa  140  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  27.34 
 
 
790 aa  140  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1166  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
507 aa  140  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
614 aa  140  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
774 aa  140  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
484 aa  140  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  26.86 
 
 
774 aa  140  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  34.18 
 
 
508 aa  139  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
377 aa  139  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  28.53 
 
 
1046 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
605 aa  138  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1284  sensor histidine kinase  30.52 
 
 
475 aa  138  8e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  30.54 
 
 
783 aa  137  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
769 aa  137  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  30.54 
 
 
783 aa  137  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 
940 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
582 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
600 aa  136  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
775 aa  136  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  34.01 
 
 
771 aa  136  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 
1260 aa  136  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 
769 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  30.88 
 
 
599 aa  135  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
763 aa  135  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
456 aa  135  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 
744 aa  135  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 
674 aa  135  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.04 
 
 
874 aa  135  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.85 
 
 
989 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
769 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
797 aa  134  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>