133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4604 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  57.49 
 
 		 211 aa  244  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  59.31 
 
 		 213 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  56.86 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.5 
 
 		 217 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.21 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.03 
 
 		 220 aa  121  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.86 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.45 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.25 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.41 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.02 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.09 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.37 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.75 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.75 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  26.8 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.64 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.02 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  29.27 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  29.27 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  29.27 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  28.78 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.5 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.68 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.26 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.34 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  27.45 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.94 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.81 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.67 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.37 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.96 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.22 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.63 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.02 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.17 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.5 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.9 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.27 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.27 
 
 		 370 aa  61.6  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.47 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.19 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.29 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  26.98 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.47 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.9 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.17 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  26.13 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.46 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.54 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.76 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 		 546 aa  55.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.67 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  27.05 
 
 		 331 aa  55.1  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  27.55 
 
 		 331 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.74 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  31.43 
 
 		 334 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.66 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.66 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.98 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.57 
 
 		 335 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.5 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.38 
 
 		 331 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  26.09 
 
 		 331 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  25.7 
 
 		 338 aa  52.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 331 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  26.57 
 
 		 331 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 331 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 331 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2876  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.37 
 
 		 406 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.7 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  26.29 
 
 		 339 aa  52.4  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.48 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  35.17 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.23 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  24.87 
 
 		 406 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0739  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.35 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.91151  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 331 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.43 
 
 		 369 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.18 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  25.15 
 
 		 360 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.02 
 
 		 333 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.69 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.46 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.69 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  23.45 
 
 		 417 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  30.71 
 
 		 334 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.3 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.68 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0179  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.71 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  34.72 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  34.72 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  34.72 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  34.72 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>