More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4124 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
217 aa  446  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  84.33 
 
 
217 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  83.87 
 
 
228 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  82.49 
 
 
228 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  81.48 
 
 
216 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  79.91 
 
 
216 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  81.4 
 
 
256 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  61 
 
 
216 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  52 
 
 
201 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  54 
 
 
210 aa  222  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  51.5 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.5 
 
 
204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  48.24 
 
 
200 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  48.24 
 
 
200 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.24 
 
 
200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  48.24 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.22 
 
 
198 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.74 
 
 
200 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.24 
 
 
200 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  45.18 
 
 
204 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  46.94 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  43.56 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.23 
 
 
200 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  44.5 
 
 
198 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  43.84 
 
 
203 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  43.84 
 
 
203 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  45.54 
 
 
200 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  45.54 
 
 
200 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  42.58 
 
 
208 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  38.89 
 
 
199 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  41.92 
 
 
204 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  42.57 
 
 
208 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.56 
 
 
200 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  42.71 
 
 
218 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1985  glutathione S-transferase  42.19 
 
 
207 aa  149  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  38.69 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  41.54 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.54 
 
 
195 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  44.15 
 
 
204 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  41.54 
 
 
195 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2269  Glutathione S-transferase domain  41.92 
 
 
195 aa  141  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0017  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.69 
 
 
192 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268724  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  40.72 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.27 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.35 
 
 
201 aa  138  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  38.69 
 
 
201 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.72 
 
 
203 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.34 
 
 
208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  37.24 
 
 
196 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  36.73 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  38.83 
 
 
196 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.1 
 
 
208 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  34.62 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.1 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  36.49 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  34.62 
 
 
208 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.1 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.54 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
207 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  35.35 
 
 
206 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  32.85 
 
 
207 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  34.33 
 
 
205 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  33.83 
 
 
203 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  34 
 
 
208 aa  104  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  32.69 
 
 
203 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  34.98 
 
 
199 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 
209 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  33.64 
 
 
225 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  34 
 
 
214 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  34 
 
 
214 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  34 
 
 
214 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0974  Glutathione S-transferase domain protein  32.49 
 
 
209 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2973  glutathione S-transferase-like  31.31 
 
 
206 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00286843  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  33 
 
 
213 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  33.83 
 
 
203 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 
214 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  31.25 
 
 
214 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  35.5 
 
 
199 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.02 
 
 
221 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 
214 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.41 
 
 
227 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2207  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.49 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  33.5 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  32.84 
 
 
209 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3742  glutathione S-transferase family protein  31.47 
 
 
208 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495095  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2021  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.47 
 
 
208 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203063  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  34.36 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  32.84 
 
 
198 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  31.73 
 
 
203 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  32.67 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0209  glutathione S-transferase-like  29.03 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  31.73 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  34.33 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  33.66 
 
 
220 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  32.5 
 
 
197 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>