More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3742 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3742  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 		 208 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2021  glutathione S-transferase domain-containing protein  98.56 
 
 		 208 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2207  glutathione S-transferase domain-containing protein  90.38 
 
 		 209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0974  Glutathione S-transferase domain protein  61.54 
 
 		 209 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0144  glutathione S-transferase  50 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1560  glutathione S-transferase-like  48.06 
 
 		 210 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25247  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2869  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.99 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491062  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0837  glutathione S-transferase domain protein  44.33 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2973  glutathione S-transferase-like  42.57 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00286843  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  32.99 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  33.67 
 
 		 210 aa  104  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  32.49 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  31.98 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  31.47 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  31.4 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  29.95 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  31.47 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  34.17 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.96 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  30.96 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.93 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  30.96 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.87 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.88 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  30.96 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.93 
 
 		 214 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  29.44 
 
 		 200 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.47 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  31.37 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  32.14 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.46 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  30.61 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  31.25 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.07 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.37 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  30.66 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  32.49 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 		 221 aa  91.7  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.63 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  29.95 
 
 		 201 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  28.93 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  28.21 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  30.3 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.12 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.51 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  32.66 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  29.49 
 
 		 209 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.12 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  28.21 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  30.93 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  31.09 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  29.08 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  27.98 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  27.55 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  31.86 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4748  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.65 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  26.02 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0822  Glutathione S-transferase domain protein  31.16 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  29.95 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  30.69 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  31.07 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  30.69 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2587  Glutathione S-transferase domain  29.35 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  29.74 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.81 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  28.87 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.72 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  29.95 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2312  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.8 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.93 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  29.32 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  25.93 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  28.35 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  28.89 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.53 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.1 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  29.26 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  26.94 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  30.93 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  28.49 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  28.85 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  27.32 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  28.85 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  29.33 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  27.7 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5133  Glutathione S-transferase domain  31.34 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  29.33 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  28.44 
 
 		 266 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3587  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0707812  hitchhiker  0.000377551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.59 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.08 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  28.44 
 
 		 300 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.29 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>