More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3035 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1810  polyketide synthase protein  39.2 
 
 		 2380 aa  1249    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362155  normal  0.526323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3035  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2257 aa  4539    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  47.24 
 
 		 3163 aa  503  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  55.13 
 
 		 3173 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  45.16 
 
 		 1909 aa  470  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  48.05 
 
 		 3275 aa  461  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  48.41 
 
 		 1424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  46.41 
 
 		 3194 aa  452  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  50.29 
 
 		 1911 aa  439  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  45.17 
 
 		 1653 aa  435  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  44.16 
 
 		 2604 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  49.36 
 
 		 1302 aa  433  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  47.25 
 
 		 2896 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  49.78 
 
 		 1466 aa  426  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  46.54 
 
 		 2498 aa  418  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  47.31 
 
 		 3089 aa  419  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  45.12 
 
 		 2679 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  46.35 
 
 		 1520 aa  412  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  44.33 
 
 		 1582 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  50.59 
 
 		 3093 aa  414  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  44.23 
 
 		 3090 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  49.41 
 
 		 4646 aa  409  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  48.25 
 
 		 3235 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  45.81 
 
 		 2684 aa  404  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1978  beta-ketoacyl synthase  50.47 
 
 		 926 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.690285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  40.82 
 
 		 2710 aa  402  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  45.68 
 
 		 1535 aa  403  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  44.1 
 
 		 4186 aa  400  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  44.08 
 
 		 4647 aa  400  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  48.73 
 
 		 3108 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  43.51 
 
 		 1612 aa  396  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  44.84 
 
 		 1574 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  43.32 
 
 		 1612 aa  395  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2366  polyketide synthase  44.25 
 
 		 1560 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  45.85 
 
 		 1488 aa  390  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  43.37 
 
 		 1470 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  41.37 
 
 		 1646 aa  387  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  46.22 
 
 		 1497 aa  387  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  40.85 
 
 		 1000 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  40.08 
 
 		 1408 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  43.57 
 
 		 2682 aa  386  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  44.68 
 
 		 2093 aa  387  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  41.22 
 
 		 995 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  43.91 
 
 		 1489 aa  382  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  42.34 
 
 		 2176 aa  384  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  47.78 
 
 		 3130 aa  384  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  43.22 
 
 		 1560 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  43 
 
 		 3335 aa  383  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  44.44 
 
 		 1472 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  44.44 
 
 		 1472 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  44.44 
 
 		 1472 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  43.78 
 
 		 995 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2363  polyketide synthase  45.07 
 
 		 1525 aa  377  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  39.61 
 
 		 2316 aa  372  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  42.75 
 
 		 2273 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  42.94 
 
 		 1466 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  43.5 
 
 		 2454 aa  369  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  39.59 
 
 		 2150 aa  370  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1566  polyketide synthase, type I  45.14 
 
 		 1329 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0138  TubD protein  45.14 
 
 		 1353 aa  367  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1647  polyketide synthase, type I  45.14 
 
 		 1329 aa  367  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.052108  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1235  JamP  44.12 
 
 		 1370 aa  367  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  45.82 
 
 		 1795 aa  366  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  48.05 
 
 		 3133 aa  363  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  48.05 
 
 		 4265 aa  363  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  48.05 
 
 		 3127 aa  363  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  48.05 
 
 		 4265 aa  363  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  48.05 
 
 		 4239 aa  363  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  37.64 
 
 		 1833 aa  356  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  42.37 
 
 		 1416 aa  356  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  41.91 
 
 		 974 aa  355  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  41.87 
 
 		 2226 aa  355  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  41.67 
 
 		 2243 aa  355  8e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3070  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.5 
 
 		 1208 aa  354  8.999999999999999e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2429  thiotemplate mechanism natural product synthetase  43.91 
 
 		 1160 aa  353  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336894  hitchhiker  0.00172605 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  40.9 
 
 		 1465 aa  352  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2267  amino acid adenylation  42.61 
 
 		 3031 aa  352  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.962511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  44.01 
 
 		 1530 aa  348  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  44.01 
 
 		 1530 aa  348  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  43.52 
 
 		 1528 aa  347  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  43.52 
 
 		 1524 aa  346  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.61 
 
 		 1587 aa  345  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  38.8 
 
 		 1939 aa  345  5e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1794  amino acid adenylation  42.03 
 
 		 3064 aa  344  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  40.08 
 
 		 2232 aa  342  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.51 
 
 		 1656 aa  342  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6994  Beta-ketoacyl synthase  44.37 
 
 		 1276 aa  340  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.92 
 
 		 3676 aa  340  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  45.13 
 
 		 1486 aa  340  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.15 
 
 		 3696 aa  338  7e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  43.21 
 
 		 2792 aa  336  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  43 
 
 		 1474 aa  336  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  38.11 
 
 		 2333 aa  333  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.65 
 
 		 2136 aa  330  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2383  condensation domain protein  37.38 
 
 		 2006 aa  330  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  42.4 
 
 		 3427 aa  330  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  42.77 
 
 		 2880 aa  330  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  41.7 
 
 		 3424 aa  329  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.25 
 
 		 3693 aa  329  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.25 
 
 		 3693 aa  329  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>