220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2971 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  100 
 
 		 200 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  65.15 
 
 		 199 aa  264  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  65.66 
 
 		 200 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  62 
 
 		 200 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  52.85 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  52.85 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  49.49 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  45.13 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  40.31 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  39.79 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  34.2 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  42.6 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  42.94 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  40.56 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  36.02 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  36.53 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  44.35 
 
 		 1287 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  40 
 
 		 195 aa  95.5  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  34.46 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  31.49 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  33.93 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  29.27 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  29.27 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  33.72 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  32.34 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  29.3 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  31.46 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  33.09 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.27 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  32.62 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  33.77 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  34.09 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  33.74 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  28.89 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  31.79 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  32.03 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  29.09 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  31.71 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  31.71 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  31.71 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1586  hypothetical protein  37.96 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.728643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  31.71 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  31.71 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  31.71 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1283  hypothetical protein  37.04 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0336066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  29.88 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  36.67 
 
 		 440 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  29.82 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  29.82 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  33.14 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  29.82 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  29.82 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  29.82 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.86 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  29.82 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0083  hypothetical protein  37.04 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  34.9 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1503  hypothetical protein  37.04 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1627  methyltransferase type 12  34.42 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  28.95 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1050  hypothetical protein  37.17 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  33.09 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0037  hypothetical protein  37.17 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0377  hypothetical protein  37.17 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1207  hypothetical protein  37.17 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  28.07 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2140  methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565614  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  28.95 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  34.07 
 
 		 309 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 337 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.91 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.76 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2456  methyltransferase type 11  30 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  27.39 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.77 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  25 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  33.6 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  30.37 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>