47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2030 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2030  calcium-binding EF-hand  100 
 
 		 251 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  42.44 
 
 		 282 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  27.82 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  33.07 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  28.38 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  36.59 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  26.21 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  26.21 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  30.08 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  26.67 
 
 		 149 aa  52.4  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  26.9 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5532  putative signal transduction protein with EFhand domain  35.66 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  0.0443001 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  34.11 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  28.36 
 
 		 149 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28876  calmodulin  30 
 
 		 149 aa  50.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.603426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1772  calcium-binding EF-hand  41.79 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389103  normal  0.418687 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 		 149 aa  49.3  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  28.77 
 
 		 522 aa  49.7  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  30.25 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  26.4 
 
 		 163 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3184  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.19 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53519  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52444  caltractin  28.57 
 
 		 192 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  29.41 
 
 		 212 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1450  putative signal transduction protein with EFhand domain  29.09 
 
 		 174 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.755568  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5447  putative signal transduction protein with EFhand domain  28.75 
 
 		 173 aa  45.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  26.47 
 
 		 479 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2609  hypothetical protein  28.77 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1615  calcium-binding EF-hand  41.94 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.05 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.87 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0283  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  36.92 
 
 		 389 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0438498 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1140  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.45 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06566  calcineurin subunit B, putative (Eurofung)  25.16 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376236  normal  0.7072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  35.94 
 
 		 387 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  24.24 
 
 		 149 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  35.94 
 
 		 387 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  22.79 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  27.37 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1545  Calcium-binding EF-hand-containing protein  34.67 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1948  Calcium-binding EF-hand-containing protein  27.78 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2925  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.5 
 
 		 802 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0821  calcium-binding EF-hand-containing protein  36.36 
 
 		 138 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.661714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5866  hypothetical protein  38.6 
 
 		 137 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  25 
 
 		 164 aa  42.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0152  signal transduction protein  45.65 
 
 		 140 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.59 
 
 		 209 aa  42  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87042  predicted protein  31.68 
 
 		 174 aa  42  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>