More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0231 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0231  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
378 aa  776    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.282789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
385 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  35.46 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
382 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.59 
 
 
373 aa  205  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  32 
 
 
387 aa  205  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
391 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
383 aa  169  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
378 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
392 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
371 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1323  glycosyltransferase  29.37 
 
 
370 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.59185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
379 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2648  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
236 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
389 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.87 
 
 
365 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
384 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
385 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
388 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
382 aa  103  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
362 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
403 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  25.13 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  25.44 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25.32 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0759  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  25.2 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  23.81 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3566  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
389 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  26.54 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
378 aa  77  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2730  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  23.33 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
765 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5390  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.75 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  21.65 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  21.54 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  25.21 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  22.55 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.18 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  21.96 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  22.57 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.27 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  21.33 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  21.75 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  27.04 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1082  putative glycosyltransferase  27.1 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  22.28 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  21.56 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
763 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  27.22 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  26.61 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  22.75 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  22.57 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  23.79 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  22.16 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  23.73 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04491  putative glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
424 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>