More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3156 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  79.33 
 
 		 433 aa  678    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  855    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  79.46 
 
 		 431 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  79.22 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3887  major facilitator transporter  58.65 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.218515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  57.21 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  54.24 
 
 		 433 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  49.02 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.28 
 
 		 429 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 		 448 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  42.32 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 434 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0687  major facilitator superfamily permease  42.48 
 
 		 436 aa  292  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4685  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 428 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1970  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5586  major facilitator superfamily permease  34.05 
 
 		 441 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14863  normal  0.124854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.15 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  27.23 
 
 		 428 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  27.23 
 
 		 428 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  27.23 
 
 		 428 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  26.4 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  27 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 443 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  27.23 
 
 		 436 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  26.28 
 
 		 432 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 433 aa  136  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 434 aa  136  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  26.28 
 
 		 432 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  26.28 
 
 		 432 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 428 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 430 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  27.21 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  27.87 
 
 		 478 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  26.7 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  26.17 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  26.96 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  26.96 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  26.96 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  26.17 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  26.96 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  26.96 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 463 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.57 
 
 		 448 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 436 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 436 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 436 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 439 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  24.94 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.51 
 
 		 449 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 447 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.75 
 
 		 456 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 431 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  27.48 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  27.48 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.48 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  27.48 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  27.48 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>