More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3083 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2704  M20/M25/M40 family peptidase  94.16 
 
 		 394 aa  721    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.516059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2995  amidohydrolase  86.55 
 
 		 394 aa  698    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.505357  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3083  amidohydrolase  100 
 
 		 394 aa  816    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.684536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3048  amidohydrolase  94.92 
 
 		 394 aa  728    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0406772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  53.89 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  49.87 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  49.87 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  49.87 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  49.87 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  49.87 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  49.87 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  49.87 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  51.18 
 
 		 396 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  50.65 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  50.79 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  50.79 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  50.79 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  50.13 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  49.87 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  50.52 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  50.26 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  51.18 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  49.48 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  50.13 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  49.87 
 
 		 387 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  49.48 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  50.93 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  50.4 
 
 		 403 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  50.79 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  49.6 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  50.4 
 
 		 404 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  49.34 
 
 		 404 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  50.13 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  49.07 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  50.66 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  49.07 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  50.52 
 
 		 395 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 395 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  50.27 
 
 		 394 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  47.79 
 
 		 389 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  47.66 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  46.32 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  49.22 
 
 		 392 aa  352  8.999999999999999e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  48.4 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  48.4 
 
 		 396 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  48.4 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  47.23 
 
 		 425 aa  348  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  47.3 
 
 		 405 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  45.38 
 
 		 379 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  47.86 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  47.78 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  46.17 
 
 		 401 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  47.78 
 
 		 396 aa  346  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  47.66 
 
 		 396 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  47.26 
 
 		 396 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  47.66 
 
 		 396 aa  345  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  48.81 
 
 		 407 aa  344  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  47.86 
 
 		 396 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  47.62 
 
 		 389 aa  344  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  46.13 
 
 		 406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  47.78 
 
 		 402 aa  343  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  47.91 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  46.7 
 
 		 398 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.29 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  48.31 
 
 		 389 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  47.19 
 
 		 396 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  44.33 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  46.19 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  47.31 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  47.14 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  45.01 
 
 		 399 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  48.27 
 
 		 373 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.58 
 
 		 397 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  45.53 
 
 		 403 aa  335  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.86 
 
 		 404 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.25 
 
 		 398 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  45.38 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  44.47 
 
 		 388 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  46.25 
 
 		 396 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.25 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  49.34 
 
 		 395 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  49.34 
 
 		 395 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  49.34 
 
 		 395 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  46.34 
 
 		 401 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  47.14 
 
 		 415 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  46.25 
 
 		 396 aa  332  9e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  47.14 
 
 		 415 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  47.14 
 
 		 396 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  47.63 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  47.23 
 
 		 398 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  46.25 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  46.77 
 
 		 391 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  46.77 
 
 		 389 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  46.07 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  45.81 
 
 		 388 aa  330  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  46.04 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  47.23 
 
 		 407 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  46.35 
 
 		 399 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  43.65 
 
 		 393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>