29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1637 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  100 
 
 		 314 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  50.42 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  44.83 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  51.46 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  39.42 
 
 		 213 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  37.23 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  45.36 
 
 		 247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  41.13 
 
 		 212 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  42.57 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  46.08 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  51 
 
 		 224 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  43.4 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  38.21 
 
 		 274 aa  92.4  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  46.07 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  43 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  27.37 
 
 		 109 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  26.15 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  27.78 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  27.78 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  30.91 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  29.09 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  32.73 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  28.99 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  37.66 
 
 		 426 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>