73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1396 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  64.66 
 
 		 140 aa  183  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  60 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  48.46 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  46.72 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  46.32 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  46.92 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  50.77 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  46.15 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  48.46 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  45.8 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  43.57 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  45.26 
 
 		 140 aa  120  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  34.62 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  36.15 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  35.2 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  35.2 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  31.54 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1945  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.755475  normal  0.160304 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  33.07 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  38.54 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  50 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  31.2 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  37.36 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  30.61 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  31.48 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  29.46 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  28.97 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  32.26 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  31.78 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  27.74 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  34.31 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  29.71 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  35.63 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  34.52 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  27.05 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  27.27 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  31.96 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  29.05 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  27.36 
 
 		 292 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  28.15 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  34.78 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  29.31 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  32.71 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  34.57 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  27.93 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  30.08 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0429  hypothetical protein  31.3 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0671683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  31.18 
 
 		 295 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  29.27 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  32.22 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  27.68 
 
 		 276 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  29.1 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  26.67 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2107  hypothetical protein  32.14 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0461455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1403  hypothetical protein  24.62 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0680673  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  26.21 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  29.91 
 
 		 271 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  25.71 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1314  hypothetical protein  28.72 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2901  protein of unknown function DUF86  22.83 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  30.86 
 
 		 252 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  32.18 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  27.82 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1202  protein of unknown function DUF86  31.58 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  29.06 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  25.74 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  27.96 
 
 		 112 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0257  protein of unknown function DUF86  28.07 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2316  hypothetical protein  31 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0239991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  32.53 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>