79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1051 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1051  transposase Tn3  100 
 
 		 171 aa  348  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  64.71 
 
 		 989 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  65.29 
 
 		 988 aa  231  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  64.71 
 
 		 990 aa  229  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  64.71 
 
 		 990 aa  229  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  64.71 
 
 		 990 aa  229  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  64.71 
 
 		 990 aa  229  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  64.12 
 
 		 526 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  63.74 
 
 		 988 aa  228  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  63.74 
 
 		 988 aa  228  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  63.74 
 
 		 988 aa  228  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  63.74 
 
 		 988 aa  228  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  62.94 
 
 		 988 aa  227  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  63.53 
 
 		 990 aa  227  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  63.53 
 
 		 990 aa  227  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  62.57 
 
 		 988 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  64.12 
 
 		 990 aa  225  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  60.59 
 
 		 985 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  57.65 
 
 		 989 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  58.48 
 
 		 964 aa  202  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  56.14 
 
 		 988 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  54.39 
 
 		 731 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  57.06 
 
 		 988 aa  191  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  55.29 
 
 		 988 aa  185  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  55.29 
 
 		 988 aa  185  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  52.35 
 
 		 988 aa  184  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  51.76 
 
 		 988 aa  184  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  51.76 
 
 		 988 aa  184  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  52.35 
 
 		 988 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  52.35 
 
 		 1015 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  45.29 
 
 		 988 aa  161  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  45.29 
 
 		 988 aa  161  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  45.29 
 
 		 988 aa  161  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  43.45 
 
 		 440 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  43.45 
 
 		 994 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  43.45 
 
 		 994 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  43.2 
 
 		 994 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  35.76 
 
 		 991 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  37.87 
 
 		 992 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  36.36 
 
 		 999 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  33.33 
 
 		 961 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  32.76 
 
 		 358 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  40.35 
 
 		 983 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  33.94 
 
 		 991 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  33.94 
 
 		 991 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  36.31 
 
 		 738 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3677  hypothetical protein  34.1 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.472291 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  32.76 
 
 		 400 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  32.35 
 
 		 987 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  33.92 
 
 		 992 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  33.92 
 
 		 992 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  33.93 
 
 		 996 aa  93.2  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  33.93 
 
 		 996 aa  93.2  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  37.76 
 
 		 996 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  33.93 
 
 		 996 aa  93.2  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  34.34 
 
 		 877 aa  91.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  33.92 
 
 		 988 aa  91.7  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4124  transposase Tn3  47.92 
 
 		 102 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632177 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  36.09 
 
 		 988 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  36.09 
 
 		 988 aa  85.9  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  34.9 
 
 		 612 aa  85.1  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  32.1 
 
 		 968 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  32.43 
 
 		 771 aa  70.9  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  29.82 
 
 		 983 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6366  transposase  29.59 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  32.64 
 
 		 1006 aa  64.3  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 		 492 aa  60.8  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  28.24 
 
 		 991 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  28.24 
 
 		 991 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  31.39 
 
 		 1075 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  29.22 
 
 		 1028 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  26.56 
 
 		 974 aa  47.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  29.38 
 
 		 1029 aa  47.8  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  29.45 
 
 		 916 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  28 
 
 		 997 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0198  transposase, putative  27.03 
 
 		 499 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0237  transposase, putative  27.03 
 
 		 499 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  32.1 
 
 		 570 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  45.71 
 
 		 862 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>