282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1505 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 146 aa  306  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  68.28 
 
 		 146 aa  227  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  52.82 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  51.39 
 
 		 147 aa  159  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  50.7 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  49.65 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  53.28 
 
 		 153 aa  156  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  50.35 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  50.35 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  50.35 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  50.35 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  50.35 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  50.35 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  50.35 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  50.35 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  50.7 
 
 		 152 aa  154  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  50.34 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  45.83 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  52.59 
 
 		 139 aa  133  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  44.06 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  48.12 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  43.66 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  48.03 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  42.62 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  48.03 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  41.1 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  45.53 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  47.79 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  44.96 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  40.28 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5463  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  40.66 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  35.66 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  33.81 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  36.61 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  35.65 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  35.16 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  36.17 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  33.33 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  36.56 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  34.48 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  31.36 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  34.55 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  33.65 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  34.04 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  35.96 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  35.56 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0423  HIT family hydrolase  28.23 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  33.06 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  35.11 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  36.17 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1691  HIT family protein  34.72 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  32.77 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1291  HIT family protein  31.25 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.691184  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  29.25 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  35.48 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  28.7 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  30.56 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  35.16 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  35 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  28.93 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  33.71 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1768  HIT family protein  30.43 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  29.91 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  28.3 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  32.17 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  34.31 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  30.1 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  34.04 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2873  histidine triad (HIT) protein  29.92 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.635304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  27.78 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  35.79 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  32.46 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  33.68 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  31.67 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  30.34 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  31.11 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  31.11 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  27.15 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0082  HIT family protein  32.53 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  30.28 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>