More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1073 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  527  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  59.36 
 
 		 265 aa  318  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  60.73 
 
 		 259 aa  314  8e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  61 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  55.14 
 
 		 253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  49.79 
 
 		 264 aa  258  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  51.03 
 
 		 261 aa  255  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  48.39 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  48.96 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  48.13 
 
 		 302 aa  242  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  48.36 
 
 		 254 aa  239  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  50.4 
 
 		 298 aa  239  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  52.48 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  48.95 
 
 		 264 aa  238  9e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  48.78 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  46.96 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  45.04 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  46.06 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  43.72 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  40.59 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  40.65 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  42.74 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  40.87 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40.33 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  41.04 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  41.56 
 
 		 246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  41.46 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  40 
 
 		 333 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  41.94 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  39.92 
 
 		 274 aa  191  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  40.26 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  39.67 
 
 		 248 aa  188  7e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  39.09 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  41.15 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  40.74 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  39.37 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  40.66 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  38.24 
 
 		 333 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0576  methionine import ATP-binding protein MetN  44.59 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  40.66 
 
 		 357 aa  184  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  41.08 
 
 		 362 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  40.91 
 
 		 359 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  38.78 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  40.25 
 
 		 361 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  40.25 
 
 		 361 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  39.58 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.32 
 
 		 264 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  39.17 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  39.17 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  39.17 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  39.17 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  39.09 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  40.4 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  39.17 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  38.75 
 
 		 303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  39 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  39 
 
 		 278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  40.25 
 
 		 361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  40.08 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0474  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.381498  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  38.78 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  38.4 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  39.5 
 
 		 378 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  38 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  38.75 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  39.09 
 
 		 397 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  40 
 
 		 421 aa  178  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  38.66 
 
 		 363 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  41.23 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  38.82 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  35.83 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  38.74 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  38.55 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.55 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  39.36 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  37.7 
 
 		 273 aa  175  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  36.67 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 280 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  45.66 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  38.82 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  37.92 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  37.8 
 
 		 273 aa  174  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  37.4 
 
 		 257 aa  174  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  38.75 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  40.76 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  36.1 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  39.59 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  37.3 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>