More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0317 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 322 aa  674    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  47.21 
 
 		 329 aa  288  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.31 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  44.3 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  42.35 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  42.35 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  42.34 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  27.96 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  30.77 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.13 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  31.73 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  31.13 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.63 
 
 		 302 aa  93.6  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  32.51 
 
 		 326 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.33 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  29.92 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  38.58 
 
 		 348 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  33.62 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  43.4 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.39 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.46 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  28.91 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.4 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.06 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  25.77 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.28 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.42 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 1171 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  27.49 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  24.85 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.61 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.37 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  29.37 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.37 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.71 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.06 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.58 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 801 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.58 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.16 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  37.27 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 		 573 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2447  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 746 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0352  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  34.26 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  35.35 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>