211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0301 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  87.65 
 
 		 243 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  46.03 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  43.55 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  44.03 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  43.62 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  44.25 
 
 		 252 aa  198  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  46.82 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  46.36 
 
 		 249 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  46.95 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  46.95 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  46.95 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  47.64 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  47.64 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  47.42 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  47.64 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  47.64 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  47.64 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  47.64 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  47.64 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  47.17 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  45.12 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  44.09 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  46.01 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  43.18 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  42.73 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  36.19 
 
 		 260 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  35.27 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  36.71 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  35.16 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  34.65 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  31.74 
 
 		 263 aa  138  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  35.56 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  30.8 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  28.43 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  30.86 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  28.39 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  32.5 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 265 aa  98.6  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  25.77 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  27.38 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  27 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  25 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  25.82 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 283 aa  89  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  30.62 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  30.73 
 
 		 283 aa  85.5  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  29.33 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  29.8 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  28.23 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  28.16 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  28.95 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  30.66 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  28.95 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  30.05 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  36.36 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  28.42 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  30.39 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  28.72 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  35.83 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  25.86 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  24.03 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  27.81 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  27.59 
 
 		 322 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  28.21 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  34.48 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  33.9 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  27.46 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  35.34 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  29.1 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  33.9 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  33.9 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  33.9 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  33.9 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  33.9 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  33.9 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  33.9 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  33.9 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  33.9 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  24.89 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  26.76 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  20.97 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  23.94 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  33.9 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>