264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3052 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3052  patatin  100 
 
 		 394 aa  808    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  73.1 
 
 		 444 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  69.53 
 
 		 359 aa  521  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  53.28 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  53.06 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  52.78 
 
 		 346 aa  359  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  50.66 
 
 		 365 aa  352  8e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  52.1 
 
 		 343 aa  348  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  48.6 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  47.9 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  46.98 
 
 		 405 aa  302  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  46.2 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  47.06 
 
 		 375 aa  299  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  46.2 
 
 		 382 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  44.07 
 
 		 353 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  44.38 
 
 		 349 aa  292  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  45.86 
 
 		 382 aa  288  9e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  44.39 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  43.77 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  43.77 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  43.75 
 
 		 349 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  43.75 
 
 		 349 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  46.58 
 
 		 414 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  46.58 
 
 		 414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  43.54 
 
 		 349 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  43.65 
 
 		 360 aa  282  6.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  44.54 
 
 		 375 aa  282  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  43.75 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  45.66 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  43.29 
 
 		 346 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  43.3 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  42.94 
 
 		 383 aa  272  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  44.11 
 
 		 358 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  42.46 
 
 		 357 aa  263  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  40.17 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  42.3 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  40.87 
 
 		 350 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  41.5 
 
 		 340 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  39.32 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  40.83 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  39.66 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  40.65 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  38.02 
 
 		 348 aa  236  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  37.71 
 
 		 347 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  39.94 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  43.85 
 
 		 351 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  37.61 
 
 		 342 aa  225  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  39.05 
 
 		 315 aa  223  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  36.84 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  37.88 
 
 		 352 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  38.54 
 
 		 346 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  34.47 
 
 		 370 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  34.01 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  32.93 
 
 		 470 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  34.96 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  33.43 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  31.12 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  30 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  30.59 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  29.43 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  33.57 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  27.99 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  28.38 
 
 		 365 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  28.48 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  29.14 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  31.21 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  30.86 
 
 		 339 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  29.96 
 
 		 423 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  29.22 
 
 		 442 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  29.67 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  28.57 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  29.37 
 
 		 389 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.69 
 
 		 765 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  30.67 
 
 		 387 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  29.75 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  28.53 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  26.68 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.58 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  26.44 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  29.69 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.76 
 
 		 763 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  26.44 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  26.44 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  26.44 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  29.89 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  28.72 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  28.83 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  31.71 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  31.71 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  28.76 
 
 		 375 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  29.87 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  29.94 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  29.41 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  26.89 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  26.89 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  26.89 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  26.89 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  26.89 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  26.89 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  26.89 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>