More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1940 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1940  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
507 aa  1006    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.41 
 
 
495 aa  355  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  39.21 
 
 
496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0037  peptidase M50  35.83 
 
 
501 aa  306  7e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0037  peptidase M50  35.83 
 
 
501 aa  306  7e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  31.13 
 
 
439 aa  194  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  28.35 
 
 
428 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  29.52 
 
 
466 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  28.95 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  28.11 
 
 
452 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  27.22 
 
 
469 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.55 
 
 
448 aa  154  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  28.08 
 
 
454 aa  153  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2621  membrane-associated zinc metalloprotease  27.54 
 
 
430 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0313354  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  28.85 
 
 
452 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1638  membrane-associated zinc metalloprotease  28.92 
 
 
454 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  27.93 
 
 
438 aa  150  7e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.76 
 
 
561 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.61 
 
 
558 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.28 
 
 
479 aa  149  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  26.72 
 
 
456 aa  149  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  29.43 
 
 
443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.52 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  24.74 
 
 
561 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  24.74 
 
 
561 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  25.67 
 
 
463 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  27.58 
 
 
454 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  26.21 
 
 
456 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  26.01 
 
 
457 aa  144  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.92 
 
 
457 aa  144  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2341  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.83 
 
 
450 aa  144  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00281256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  27.64 
 
 
451 aa  144  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.38 
 
 
450 aa  143  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  26.36 
 
 
452 aa  143  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  26.2 
 
 
456 aa  143  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.18 
 
 
456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  26.7 
 
 
456 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28 
 
 
455 aa  141  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.7 
 
 
456 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.95 
 
 
456 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.91 
 
 
480 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.46 
 
 
456 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.52 
 
 
456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26 
 
 
453 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.88 
 
 
450 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  25.86 
 
 
452 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  27.66 
 
 
453 aa  136  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.52 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.35 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.53 
 
 
458 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.96 
 
 
450 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.56 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  26.3 
 
 
450 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  25.24 
 
 
462 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  27.27 
 
 
450 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.57 
 
 
462 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  24.19 
 
 
454 aa  133  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  26.15 
 
 
452 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.1 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  25.1 
 
 
456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.54 
 
 
455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  27.53 
 
 
451 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.21 
 
 
449 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  24.81 
 
 
456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  26.87 
 
 
475 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  27.7 
 
 
451 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0344  hypothetical protein  24.64 
 
 
619 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167454  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  26.35 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0534  protease EcfE  25.63 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.196657  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  26.35 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  26.18 
 
 
450 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  25.81 
 
 
450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  26.21 
 
 
450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  26.15 
 
 
451 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  26.82 
 
 
451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  25.3 
 
 
448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  25.35 
 
 
461 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  27.64 
 
 
450 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  27.64 
 
 
450 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  27.64 
 
 
450 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  27.64 
 
 
450 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  26.15 
 
 
450 aa  127  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.19 
 
 
452 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.19 
 
 
450 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  26.15 
 
 
450 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  26.15 
 
 
450 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  27.64 
 
 
450 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  26.15 
 
 
450 aa  126  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.64 
 
 
461 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  24.23 
 
 
494 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  26.15 
 
 
450 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  26.49 
 
 
450 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  25.29 
 
 
463 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  26.49 
 
 
450 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.48 
 
 
451 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  35.47 
 
 
348 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  25.96 
 
 
450 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.48 
 
 
439 aa  124  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.8 
 
 
446 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>