171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0243 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0243  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 		 369 aa  734    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  25.46 
 
 		 604 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.1 
 
 		 773 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0733  ComEC/Rec2-related protein  27.69 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00014366  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0604  putative competence locus E  29.27 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.790814  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  27.76 
 
 		 706 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.31 
 
 		 818 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.38 
 
 		 757 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  29.88 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.86 
 
 		 794 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1410  ComEC/Rec2-related protein  26.25 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0315554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.62 
 
 		 761 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.55 
 
 		 773 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  29.65 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.73 
 
 		 778 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.83 
 
 		 791 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  26.25 
 
 		 626 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.78 
 
 		 773 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  27.8 
 
 		 551 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  29.65 
 
 		 672 aa  64.7  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.73 
 
 		 775 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  28.83 
 
 		 611 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  24.51 
 
 		 708 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  25.87 
 
 		 795 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  26.34 
 
 		 593 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  23.53 
 
 		 773 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.8 
 
 		 795 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.41 
 
 		 796 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.98 
 
 		 759 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.29 
 
 		 773 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.25 
 
 		 841 aa  62  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  26.97 
 
 		 551 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  28.81 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  27.71 
 
 		 747 aa  60.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.12 
 
 		 840 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.15 
 
 		 789 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 		 772 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 		 773 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.82 
 
 		 798 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 		 772 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  27.86 
 
 		 843 aa  60.1  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  27.59 
 
 		 694 aa  59.7  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 		 654 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1063  ComEC/Rec2-related protein  23.21 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.98 
 
 		 780 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  29.25 
 
 		 674 aa  58.2  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.52 
 
 		 773 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  22.1 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  27.98 
 
 		 679 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2209  hypothetical protein  25.81 
 
 		 747 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785174  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  24.14 
 
 		 825 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.75 
 
 		 750 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  29.71 
 
 		 734 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  33.54 
 
 		 531 aa  57  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1320  ComEC/Rec2-related protein  24.75 
 
 		 524 aa  56.2  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.725773  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0791  ComEC/Rec2-related protein  26.29 
 
 		 1006 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.52274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.86 
 
 		 822 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  24.36 
 
 		 748 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  23.62 
 
 		 787 aa  54.3  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  24.36 
 
 		 748 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  23.31 
 
 		 494 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  24.26 
 
 		 735 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  24.26 
 
 		 735 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.21 
 
 		 802 aa  53.5  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  26.95 
 
 		 591 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  25.11 
 
 		 671 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0467  ComEC/Rec2-related protein  30.7 
 
 		 545 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  28.37 
 
 		 738 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  23.63 
 
 		 722 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  24.19 
 
 		 718 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1346  ComEC/Rec2-related protein  29.14 
 
 		 759 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.032062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.62 
 
 		 722 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.53 
 
 		 809 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  28.51 
 
 		 636 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1432  hypothetical protein  27.7 
 
 		 754 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0687894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1049  ComEC/Rec2-related protein  22.22 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0473085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  27.47 
 
 		 798 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0736  putative competence-related protein  24.7 
 
 		 768 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.32 
 
 		 752 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.17 
 
 		 797 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  25.97 
 
 		 689 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.22 
 
 		 747 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.65 
 
 		 771 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  25.13 
 
 		 684 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0804  ComEC/Rec2-related protein  22.06 
 
 		 795 aa  50.4  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.569588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf372  hypothetical protein  30.15 
 
 		 459 aa  50.4  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.72 
 
 		 770 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0785  competence protein, ComEC  26.53 
 
 		 986 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  20.64 
 
 		 493 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  22.22 
 
 		 511 aa  49.7  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  21.13 
 
 		 757 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0484  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.31 
 
 		 736 aa  49.7  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.83 
 
 		 773 aa  49.7  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0644  ComEC/Rec2-related protein  22.31 
 
 		 700 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.851772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.44 
 
 		 860 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  25.59 
 
 		 755 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.71 
 
 		 749 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2423  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.86 
 
 		 773 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395966 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.71 
 
 		 814 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  24.86 
 
 		 754 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>