44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3850 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  54.92 
 
 		 247 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  54.32 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  53.5 
 
 		 247 aa  274  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  55.33 
 
 		 241 aa  271  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  53.09 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  57.42 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  49.16 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  48.32 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  31.65 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  28.57 
 
 		 249 aa  92  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  29.82 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  22.87 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  25.21 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  24.3 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  25.22 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  25.44 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  23.58 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  22.96 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  21.74 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  24.88 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  21.24 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  21.24 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  21.24 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  22.77 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  24.65 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  24.3 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.75 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 322 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.31 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  23.69 
 
 		 251 aa  49.3  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3673  putative cation efflux protein  24.1 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  21.61 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  36.67 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12650  hypothetical protein  26.94 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  24.29 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  21.86 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  25.33 
 
 		 293 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>