More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3451 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 161 aa  334  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  86.34 
 
 		 161 aa  294  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  84.47 
 
 		 161 aa  288  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  82.61 
 
 		 161 aa  283  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  81.37 
 
 		 161 aa  280  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  80.75 
 
 		 161 aa  278  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  78.26 
 
 		 161 aa  267  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  75.62 
 
 		 161 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  76.58 
 
 		 161 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  76.25 
 
 		 161 aa  256  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  76.58 
 
 		 161 aa  254  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  74.68 
 
 		 161 aa  254  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  77.07 
 
 		 161 aa  254  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  75.32 
 
 		 161 aa  253  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.72 
 
 		 190 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  41.72 
 
 		 408 aa  123  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  38.56 
 
 		 188 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  38.56 
 
 		 188 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  38.56 
 
 		 204 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.45 
 
 		 190 aa  121  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  39.22 
 
 		 187 aa  120  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.26 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  37.91 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.89 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 188 aa  117  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  40.13 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.77 
 
 		 404 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.46 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.38 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.82 
 
 		 165 aa  113  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.5 
 
 		 188 aa  112  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  36.84 
 
 		 306 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  35.85 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  37.74 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  38.67 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 327 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  39.33 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  37.74 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  36.25 
 
 		 393 aa  107  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 193 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  36.36 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  38.06 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  38.99 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  35.81 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 393 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  37.18 
 
 		 204 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  36.36 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.29 
 
 		 311 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  36.13 
 
 		 196 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  35.95 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  32.91 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  36.18 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  34.04 
 
 		 302 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  35.82 
 
 		 226 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.07 
 
 		 311 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 		 304 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  35.44 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.4 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.28 
 
 		 311 aa  101  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  32.9 
 
 		 202 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  37.59 
 
 		 309 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  35.95 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.16 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  33.75 
 
 		 191 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  34.18 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  34.18 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2722  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.31 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  34.18 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  37.16 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  34.18 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  34.18 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  34.18 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  35.44 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  35.44 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  34.18 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  35.44 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  35.82 
 
 		 226 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  34.23 
 
 		 430 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  35.44 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  35.82 
 
 		 226 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  37.58 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  34.67 
 
 		 191 aa  99.4  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  35.82 
 
 		 311 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 		 172 aa  98.2  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5531  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.03 
 
 		 183 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0259957  decreased coverage  0.00000136774 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 		 186 aa  97.4  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  36.42 
 
 		 320 aa  97.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.88 
 
 		 186 aa  97.4  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>