More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1502 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  71.09 
 
 
586 aa  869    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  64.69 
 
 
585 aa  751    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  100 
 
 
587 aa  1194    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  70.05 
 
 
604 aa  869    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  67.8 
 
 
583 aa  827    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  73.98 
 
 
583 aa  856    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  70.36 
 
 
586 aa  852    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  42.1 
 
 
593 aa  485  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  43.31 
 
 
600 aa  488  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  42.16 
 
 
585 aa  483  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  39.87 
 
 
592 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  42.01 
 
 
591 aa  463  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  41.67 
 
 
594 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  41.23 
 
 
596 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  40.5 
 
 
593 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  40.6 
 
 
598 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  38.51 
 
 
606 aa  435  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
578 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
588 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  37.99 
 
 
582 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  38.47 
 
 
611 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  37.8 
 
 
589 aa  405  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
569 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  37.46 
 
 
581 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  39.41 
 
 
572 aa  398  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  38 
 
 
541 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  36.7 
 
 
641 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  35.99 
 
 
581 aa  385  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  39.29 
 
 
583 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  37.7 
 
 
569 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  36.87 
 
 
603 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  34.03 
 
 
579 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  36.07 
 
 
618 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.52 
 
 
610 aa  360  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  36.61 
 
 
588 aa  360  5e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  36.42 
 
 
607 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.84 
 
 
556 aa  356  7.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  36.01 
 
 
650 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  32.94 
 
 
589 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
583 aa  353  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.63 
 
 
581 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
579 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  33.73 
 
 
607 aa  346  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  34.04 
 
 
598 aa  346  6e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.95 
 
 
596 aa  344  2.9999999999999997e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.73 
 
 
583 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.08 
 
 
583 aa  340  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  35.55 
 
 
589 aa  340  5.9999999999999996e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.08 
 
 
583 aa  339  7e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  31.91 
 
 
583 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  31.91 
 
 
583 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  31.91 
 
 
583 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.91 
 
 
583 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  36.07 
 
 
604 aa  339  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.23 
 
 
587 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  35 
 
 
597 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  35.74 
 
 
595 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  33.28 
 
 
583 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  36.1 
 
 
641 aa  336  7.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.23 
 
 
555 aa  335  1e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  32.88 
 
 
577 aa  335  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  33.04 
 
 
598 aa  335  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  33.03 
 
 
584 aa  335  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  33.28 
 
 
590 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  36.69 
 
 
604 aa  335  2e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  33.33 
 
 
583 aa  334  3e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  31.73 
 
 
583 aa  334  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  35.86 
 
 
578 aa  333  4e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.91 
 
 
583 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 
583 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  32.92 
 
 
574 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  32.92 
 
 
574 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  36.11 
 
 
575 aa  330  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38 
 
 
598 aa  329  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  32.63 
 
 
573 aa  329  7e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  32.74 
 
 
583 aa  329  9e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  35.91 
 
 
642 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  34.45 
 
 
650 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  32.36 
 
 
577 aa  327  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  36.84 
 
 
578 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  34.03 
 
 
581 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  32.65 
 
 
600 aa  326  8.000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  33.86 
 
 
588 aa  326  8.000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  31.5 
 
 
586 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.84 
 
 
586 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  35.15 
 
 
591 aa  324  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.07 
 
 
586 aa  324  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  36.02 
 
 
603 aa  324  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.16 
 
 
586 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.25 
 
 
586 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  31.33 
 
 
586 aa  323  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  33.96 
 
 
596 aa  322  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.88 
 
 
617 aa  322  8e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  37.08 
 
 
577 aa  322  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.07 
 
 
586 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  31.15 
 
 
586 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.6 
 
 
594 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.07 
 
 
586 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  36.79 
 
 
578 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.15 
 
 
586 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>