More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0377 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0377  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
673 aa  1373    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882794  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1024  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
682 aa  298  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000464711  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
686 aa  276  7e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1098  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 
633 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0013981  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
1009 aa  139  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  25.41 
 
 
696 aa  137  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
1273 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 
680 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  23.95 
 
 
795 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1256  histidine kinase  24.45 
 
 
652 aa  113  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.3 
 
 
686 aa  108  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  27.56 
 
 
885 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  30.04 
 
 
529 aa  99.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  22.35 
 
 
782 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  31.49 
 
 
535 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  28.33 
 
 
593 aa  95.1  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
535 aa  94.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
535 aa  94.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  27.92 
 
 
496 aa  94.4  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
535 aa  94.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  21.83 
 
 
802 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  21.57 
 
 
677 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
708 aa  92  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
888 aa  90.5  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
522 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
907 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  29.78 
 
 
551 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 
524 aa  88.2  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.46 
 
 
662 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  21.53 
 
 
668 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
391 aa  87.4  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 
463 aa  87  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
460 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 
510 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  24.51 
 
 
481 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5921  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
904 aa  86.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 
902 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
316 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.4 
 
 
662 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3414  diverse 7TM receptor, extracellular region 2  23.03 
 
 
560 aa  85.1  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  26 
 
 
531 aa  84.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.87 
 
 
663 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0052  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
348 aa  84  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
897 aa  84  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2670  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 
607 aa  84  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  23.85 
 
 
751 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 
469 aa  83.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  26.39 
 
 
469 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  24.59 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0060  sensor histidine kinase  26.34 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  24.59 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1714  ATP-binding region ATPase domain protein  21.73 
 
 
666 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84327  hitchhiker  0.000293695 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  24.59 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  24.59 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.42 
 
 
662 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.68 
 
 
511 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
905 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  24.82 
 
 
689 aa  82  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 
679 aa  81.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000063575 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  24.18 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  24.18 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  24.18 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 
644 aa  81.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  23.01 
 
 
766 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  24.07 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 
476 aa  80.9  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  24.9 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  27.16 
 
 
392 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.75 
 
 
349 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00141174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  31.17 
 
 
906 aa  79.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  24.88 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  22.04 
 
 
496 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
907 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  25.19 
 
 
1344 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  26.32 
 
 
586 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  24.88 
 
 
416 aa  79  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  24.29 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  25.42 
 
 
512 aa  78.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  24.88 
 
 
416 aa  79  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  24.88 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2074  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.104517  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0056  histidine kinase  24.59 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  21.9 
 
 
660 aa  78.2  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04384  sensor protein KdpD  26.64 
 
 
886 aa  78.2  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
564 aa  78.2  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 
466 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  24.8 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
509 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 
902 aa  77.8  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
476 aa  77.8  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  24.37 
 
 
628 aa  77.8  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.75 
 
 
730 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
902 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>