276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3280 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  100 
 
 		 404 aa  832    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  36.82 
 
 		 393 aa  235  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  38.03 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.59 
 
 		 349 aa  232  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  38.72 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  39.17 
 
 		 404 aa  229  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  37.33 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  38.36 
 
 		 383 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  40.17 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  38.1 
 
 		 408 aa  222  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  37.94 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  37.69 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  37.74 
 
 		 392 aa  221  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.33 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0663  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.11 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  38.76 
 
 		 374 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  37.11 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3307  putative 4Fe-4S binding domain protein  37.43 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  39.23 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  39.1 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.83 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  36.55 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.29 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0043  domain of unknown function DUF1730  37.14 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  37.99 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.08 
 
 		 360 aa  210  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  38.48 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  39.39 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.19 
 
 		 362 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  38.32 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  36.94 
 
 		 347 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  36.46 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  36.44 
 
 		 354 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.1 
 
 		 372 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.26 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  36.84 
 
 		 354 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  37.36 
 
 		 362 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  35.99 
 
 		 359 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  35.57 
 
 		 387 aa  203  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  38.08 
 
 		 362 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  35.59 
 
 		 350 aa  202  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.26 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  36.57 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  36.26 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  37.08 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  37.61 
 
 		 355 aa  201  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1978  hypothetical protein  37.46 
 
 		 397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  36.64 
 
 		 326 aa  200  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3940  domain of unknown function DUF1730  33.57 
 
 		 445 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0385564  normal  0.0104951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  36.23 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  37.75 
 
 		 353 aa  199  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  36.42 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  36.9 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  36 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  36.8 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  36.74 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  37.71 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.25 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2899  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.71 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  37.29 
 
 		 385 aa  192  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  36.03 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.11 
 
 		 308 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1139  domain of unknown function DUF1730  35.65 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  35.67 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.08 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  34.57 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  33.98 
 
 		 356 aa  189  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  36.84 
 
 		 312 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  32.08 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  34.95 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.14 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  34.47 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  31.8 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  35.57 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0221  hypothetical protein  37.91 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  34.15 
 
 		 379 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  34.15 
 
 		 379 aa  183  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  34.15 
 
 		 379 aa  183  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  34.15 
 
 		 379 aa  183  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  34.15 
 
 		 379 aa  183  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  34.15 
 
 		 379 aa  183  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.66 
 
 		 343 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  34.15 
 
 		 379 aa  183  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  34.94 
 
 		 343 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  34.15 
 
 		 379 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1298  hypothetical protein  32.89 
 
 		 380 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000112138  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3461  iron-sulfur cluster binding protein  33.24 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  35.09 
 
 		 311 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  32 
 
 		 397 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  35.49 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3051  4Fe-4S cluster binding  35.19 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  33.71 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  33.85 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1172  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.61 
 
 		 332 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  34.15 
 
 		 404 aa  180  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1627  hypothetical protein  32.67 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  34.35 
 
 		 369 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0524  4Fe-4S cluster binding protein  36.68 
 
 		 377 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  hitchhiker  0.00311756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  34.15 
 
 		 379 aa  180  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  31.65 
 
 		 379 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>