70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2606 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  100 
 
 		 1050 aa  2141    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  24.95 
 
 		 1071 aa  178  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  21.83 
 
 		 1106 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  28.33 
 
 		 1076 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  30.53 
 
 		 802 aa  122  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  28.38 
 
 		 764 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  27.01 
 
 		 762 aa  114  7.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  27.79 
 
 		 1104 aa  111  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  27.42 
 
 		 1100 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  27.49 
 
 		 1046 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  28.21 
 
 		 847 aa  109  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  29.5 
 
 		 859 aa  107  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  28.24 
 
 		 847 aa  107  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  26.81 
 
 		 800 aa  105  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1144 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  25.35 
 
 		 658 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  26.39 
 
 		 753 aa  102  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  26.15 
 
 		 859 aa  99.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  24.76 
 
 		 1031 aa  98.6  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  23.92 
 
 		 1043 aa  98.2  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  24.82 
 
 		 653 aa  97.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  25.54 
 
 		 734 aa  93.2  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4853  hypothetical protein  26.67 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  23.43 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  24.88 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  24.31 
 
 		 517 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.55 
 
 		 513 aa  57  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  21.88 
 
 		 608 aa  56.2  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  24.66 
 
 		 523 aa  55.1  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  25.87 
 
 		 499 aa  54.3  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2056  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.28 
 
 		 552 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  25.87 
 
 		 499 aa  53.5  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0535  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.66 
 
 		 501 aa  52.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.162196  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  21.77 
 
 		 524 aa  52.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2768  hypothetical protein  26.52 
 
 		 508 aa  51.2  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  24.42 
 
 		 523 aa  51.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.21 
 
 		 520 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1340  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.88 
 
 		 515 aa  50.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  30.58 
 
 		 628 aa  50.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  32.1 
 
 		 550 aa  49.7  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2631  hypothetical protein  40.98 
 
 		 886 aa  49.7  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.703653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1783  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.54 
 
 		 555 aa  49.3  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000734669  normal  0.0773892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3713  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.85 
 
 		 580 aa  49.3  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3644  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.76 
 
 		 523 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.852861  normal  0.874146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  29.41 
 
 		 560 aa  48.5  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  38.89 
 
 		 559 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3712  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.76 
 
 		 522 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.534024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3639  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.76 
 
 		 522 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0432207  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3912  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.41 
 
 		 579 aa  48.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2022  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.35 
 
 		 557 aa  48.1  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.0150658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  24.18 
 
 		 587 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  20.67 
 
 		 611 aa  47.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2235  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.32 
 
 		 514 aa  47  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173047  normal  0.0160652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  29.46 
 
 		 360 aa  47  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  30.17 
 
 		 876 aa  46.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  30.77 
 
 		 591 aa  46.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  28.16 
 
 		 623 aa  46.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2217  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.1 
 
 		 560 aa  45.8  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1312  hypothetical protein  22.86 
 
 		 515 aa  45.8  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  32.05 
 
 		 599 aa  45.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  24.67 
 
 		 595 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4680  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.77 
 
 		 529 aa  45.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2544  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.27 
 
 		 526 aa  45.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3899  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  36.62 
 
 		 504 aa  45.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1577 aa  45.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4022  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  36.62 
 
 		 504 aa  45.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1913  ATPase-like protein  29.06 
 
 		 578 aa  45.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  26.98 
 
 		 708 aa  45.1  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  22.31 
 
 		 616 aa  44.7  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  21.97 
 
 		 571 aa  44.7  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>