More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2354 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2354  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  768    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  49.16 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  49.16 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  49.16 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  46.41 
 
 		 367 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  48.88 
 
 		 365 aa  335  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  47.75 
 
 		 365 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  48.88 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  47.19 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  48.03 
 
 		 365 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0302  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.41 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  47.19 
 
 		 365 aa  325  9e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  46.63 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  47.63 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  45.3 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  45.21 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  44.93 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  44.2 
 
 		 380 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  47.24 
 
 		 374 aa  319  6e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  46.36 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  46.96 
 
 		 378 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  47.11 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0939  hypothetical protein  46.07 
 
 		 365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.73 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  46.97 
 
 		 367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  45.21 
 
 		 377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  45.86 
 
 		 366 aa  309  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  42.82 
 
 		 383 aa  309  5.9999999999999995e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  44.54 
 
 		 366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  44.23 
 
 		 367 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  44.23 
 
 		 367 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  47.6 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  43.25 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  46.18 
 
 		 327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  44.23 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  46.48 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  46.48 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  46.17 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3420  hypothetical protein  46.91 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  46.48 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  43.8 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  45.48 
 
 		 354 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  47.81 
 
 		 347 aa  305  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  45.9 
 
 		 364 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  43.94 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3050  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 		 352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  42.13 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2878  peptide chain release factor 2  47.16 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  43.89 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  47.04 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  43.79 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  47.23 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  44.57 
 
 		 367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  44.96 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  44.96 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  44.96 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  47.29 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0826  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 		 352 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0335049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3197  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 		 352 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.710234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  48.19 
 
 		 330 aa  302  7.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  43.44 
 
 		 371 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  47.71 
 
 		 329 aa  302  7.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  45.97 
 
 		 367 aa  301  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  44.08 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  44.31 
 
 		 417 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  44.67 
 
 		 391 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  45.57 
 
 		 326 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0840  peptide chain release factor 2  46.36 
 
 		 352 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  43.92 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  44.17 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  44.9 
 
 		 349 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3615  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 		 352 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  46.63 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.26 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0872  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 		 352 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3492  peptide chain release factor 2  46.94 
 
 		 352 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  47.9 
 
 		 332 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  44.38 
 
 		 406 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  42.22 
 
 		 372 aa  298  7e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  49.09 
 
 		 331 aa  298  8e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 		 378 aa  298  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  43.44 
 
 		 359 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  43.85 
 
 		 369 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  43.72 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  48.16 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  45.26 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3297  peptide chain release factor 2  46.36 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  44.47 
 
 		 373 aa  296  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  44.02 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0811  peptide chain release factor 2  50.34 
 
 		 293 aa  296  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  43.17 
 
 		 369 aa  296  5e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  43.1 
 
 		 367 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  42.82 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  43.45 
 
 		 375 aa  295  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  50.17 
 
 		 310 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0194  peptide chain release factor 2  49.83 
 
 		 299 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  44.82 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  43.34 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>