165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2044 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2044  peptidase M50  100 
 
 
223 aa  441  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  32.5 
 
 
362 aa  78.6  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0033  peptidase M50  32.16 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.756035 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  29.24 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  35.12 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  34.32 
 
 
375 aa  68.2  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  38.89 
 
 
373 aa  68.2  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  32.54 
 
 
397 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  37.07 
 
 
387 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  32.76 
 
 
413 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  37.33 
 
 
380 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  33.33 
 
 
373 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  33.13 
 
 
376 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  35.93 
 
 
376 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  32.02 
 
 
370 aa  63.2  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  32.48 
 
 
343 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  34.31 
 
 
368 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  40.52 
 
 
412 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  39.29 
 
 
360 aa  62.4  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  28.4 
 
 
372 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  36.67 
 
 
386 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  31.72 
 
 
377 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  34.01 
 
 
293 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  31.25 
 
 
375 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  30.19 
 
 
383 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  29.41 
 
 
396 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  36.57 
 
 
395 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  31.34 
 
 
373 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  31.58 
 
 
364 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  33.33 
 
 
366 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  29.63 
 
 
372 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  32.32 
 
 
362 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  30.29 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  29.8 
 
 
291 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  33.33 
 
 
373 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  33.15 
 
 
370 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  30.71 
 
 
373 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  30.18 
 
 
390 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  29.8 
 
 
286 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  36.67 
 
 
360 aa  59.3  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  30.99 
 
 
370 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  25.91 
 
 
379 aa  58.9  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  37.58 
 
 
384 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  28.85 
 
 
344 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  35.83 
 
 
383 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  33.53 
 
 
403 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  32.68 
 
 
415 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  30.43 
 
 
366 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  34.45 
 
 
285 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  29.44 
 
 
431 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  30.72 
 
 
286 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  36.59 
 
 
380 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  35.34 
 
 
371 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  29.74 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  30.32 
 
 
412 aa  56.6  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  32.32 
 
 
416 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  36.59 
 
 
359 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  29.02 
 
 
397 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  32.8 
 
 
301 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  29.01 
 
 
290 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  30.36 
 
 
378 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  29.8 
 
 
286 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4344  stage IV sporulation protein FB  29.14 
 
 
286 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4180  stage IV sporulation protein FB  29.14 
 
 
286 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4678  stage IV sporulation protein FB  29.14 
 
 
286 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0277771  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  30.56 
 
 
395 aa  55.1  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  34.45 
 
 
378 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  28.48 
 
 
286 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  28.57 
 
 
393 aa  55.1  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  29.59 
 
 
405 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  31.85 
 
 
388 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  29.8 
 
 
286 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  30.56 
 
 
376 aa  55.1  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  35.77 
 
 
380 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4526  stage IV sporulation protein FB  28.48 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.870935 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33078  predicted protein  28.85 
 
 
315 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.638325  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2124  peptidase M50  33.58 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000917211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4191  stage IV sporulation protein FB  27.81 
 
 
286 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  37.17 
 
 
405 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0907  peptidase M50  33.71 
 
 
286 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  29.61 
 
 
424 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  32.22 
 
 
394 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  30.65 
 
 
365 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  33.88 
 
 
377 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  34.23 
 
 
417 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  34.23 
 
 
417 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  28.38 
 
 
302 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  37.93 
 
 
386 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  27.78 
 
 
342 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  29.82 
 
 
377 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  31.47 
 
 
364 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  28.57 
 
 
337 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  34.73 
 
 
374 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  34.73 
 
 
374 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  32.79 
 
 
384 aa  52.4  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  32.77 
 
 
366 aa  52.4  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  27.27 
 
 
338 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
378 aa  52  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  35.97 
 
 
1171 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  30.15 
 
 
385 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>