More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1227 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1227  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 418 aa  862    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 513 aa  332  6e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  49.42 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  45.33 
 
 		 509 aa  325  7e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  48.14 
 
 		 509 aa  325  8.000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  47.24 
 
 		 507 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  46.15 
 
 		 514 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  45.05 
 
 		 522 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  45.86 
 
 		 515 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3332  2-isopropylmalate synthase  44.96 
 
 		 528 aa  310  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  45.83 
 
 		 521 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  44.44 
 
 		 523 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  44.09 
 
 		 519 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  44.44 
 
 		 523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  45.83 
 
 		 523 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  44.9 
 
 		 518 aa  306  5.0000000000000004e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  44.17 
 
 		 523 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1111  2-isopropylmalate synthase  43.77 
 
 		 519 aa  305  7e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1205  2-isopropylmalate synthase  43.77 
 
 		 519 aa  305  8.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  46.88 
 
 		 517 aa  305  9.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  45.82 
 
 		 515 aa  305  9.000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  45.45 
 
 		 520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2131  2-isopropylmalate synthase  44.51 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2094  2-isopropylmalate synthase  44.51 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  41.58 
 
 		 524 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  44.57 
 
 		 511 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  44.23 
 
 		 510 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  41.58 
 
 		 524 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  43.25 
 
 		 524 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  43.06 
 
 		 521 aa  302  9e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0287  2-isopropylmalate synthase  44.54 
 
 		 529 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.444941 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  43.92 
 
 		 515 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  45.64 
 
 		 520 aa  300  2e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  44.04 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  46.13 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  45.82 
 
 		 527 aa  299  7e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  45.15 
 
 		 511 aa  298  8e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  43.17 
 
 		 526 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  46.13 
 
 		 516 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  43.84 
 
 		 499 aa  296  5e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  45.83 
 
 		 520 aa  295  8e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  43.75 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  45.35 
 
 		 507 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  44.8 
 
 		 516 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  44.99 
 
 		 506 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  44.57 
 
 		 506 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  45.09 
 
 		 513 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  44.57 
 
 		 506 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  45.09 
 
 		 516 aa  293  5e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1723  2-isopropylmalate synthase  44.47 
 
 		 409 aa  292  6e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  44.57 
 
 		 506 aa  292  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  44.57 
 
 		 506 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  42.58 
 
 		 520 aa  292  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  44.57 
 
 		 506 aa  292  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  44.67 
 
 		 503 aa  292  9e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  45.35 
 
 		 500 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  45.53 
 
 		 511 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  46.38 
 
 		 524 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  42.7 
 
 		 520 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  46.67 
 
 		 516 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  42.86 
 
 		 515 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  43.65 
 
 		 505 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  44.47 
 
 		 536 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  44.29 
 
 		 514 aa  290  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  42.42 
 
 		 520 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  44.73 
 
 		 520 aa  289  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  44.73 
 
 		 520 aa  289  6e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  43.65 
 
 		 525 aa  289  6e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  44.73 
 
 		 520 aa  289  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  42.66 
 
 		 519 aa  289  7e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  43.63 
 
 		 521 aa  288  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3891  2-isopropylmalate synthase  44.64 
 
 		 500 aa  288  9e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  43.29 
 
 		 555 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  44.38 
 
 		 524 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2032  2-isopropylmalate synthase  43.43 
 
 		 390 aa  288  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  44.22 
 
 		 524 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  44.13 
 
 		 532 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02609  2-isopropylmalate synthase  43.18 
 
 		 491 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  42.42 
 
 		 506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  44.7 
 
 		 527 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  44.69 
 
 		 513 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  45.69 
 
 		 504 aa  286  4e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  42.49 
 
 		 520 aa  286  4e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  43.87 
 
 		 519 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  45.06 
 
 		 515 aa  286  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  41.79 
 
 		 541 aa  286  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  45.53 
 
 		 513 aa  286  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  42.75 
 
 		 568 aa  286  5.999999999999999e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1453  2-isopropylmalate synthase  44.35 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1323  2-isopropylmalate synthase  43.54 
 
 		 513 aa  285  8e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  44.6 
 
 		 546 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  43.27 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  45.8 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  41.43 
 
 		 536 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  41.43 
 
 		 536 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  43.41 
 
 		 515 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0745  2-isopropylmalate synthase  42.66 
 
 		 524 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  42.11 
 
 		 512 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  45.95 
 
 		 512 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  44.41 
 
 		 516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>