More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0305 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0305  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 401 aa  826    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515183  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3025  DNA-directed DNA polymerase  45.43 
 
 		 408 aa  333  3e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.346367  normal  0.0754009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0324  DNA-directed DNA polymerase  43.47 
 
 		 405 aa  311  9e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.86513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2282  DNA-directed DNA polymerase  33.41 
 
 		 424 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0665124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  32.11 
 
 		 409 aa  176  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  32.47 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  31.49 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  33.87 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  31.69 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  29.32 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  32.12 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  31.04 
 
 		 407 aa  162  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  34.16 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  30.26 
 
 		 409 aa  152  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  29.31 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  30.33 
 
 		 409 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  29.02 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5590  DNA-directed DNA polymerase  34.47 
 
 		 421 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  29.16 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  28.83 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  28.74 
 
 		 371 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  26.87 
 
 		 385 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  29.19 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  25.71 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  29.01 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  34.3 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  27.74 
 
 		 413 aa  127  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.67 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  30.34 
 
 		 385 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  30.58 
 
 		 421 aa  123  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  28.86 
 
 		 419 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0957  DNA polymerase IV  32.38 
 
 		 304 aa  123  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  26.72 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  29.51 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  29.69 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  29.34 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  29.91 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  31.21 
 
 		 436 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  27.37 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  27.89 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1964  DNA-directed DNA polymerase  28.71 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.560205  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  28.53 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  35.78 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  24.94 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  28.13 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  34.26 
 
 		 481 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  29.7 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  28.77 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  28.61 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  28.13 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  28.13 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  26.82 
 
 		 417 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  36.19 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  28.5 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  25.27 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  32.49 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  32.49 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  30.93 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  28.65 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1342  DNA polymerase IV  30 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  32.31 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  28.66 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  32.08 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  28.86 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  29.2 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  33.97 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  29.5 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  27.64 
 
 		 360 aa  113  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  28.66 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0460  DNA polymerase IV  28.83 
 
 		 356 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  27.66 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0927  DNA polymerase IV  27.61 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  27.76 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  27.37 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  25.89 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  27.37 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  29.13 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  30.54 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  29.77 
 
 		 834 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  26.04 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  30.14 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002716  DNA polymerase IV  28.57 
 
 		 356 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  25.54 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  30.29 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1232  DNA polymerase IV  28.57 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46587  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  25.54 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  29.15 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  26.98 
 
 		 368 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  25.32 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  24.36 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  30.93 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  27.39 
 
 		 431 aa  110  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  26.04 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  25.37 
 
 		 413 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  29.39 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  32.22 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0962  DNA polymerase IV  31.09 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl328  DNA polymerase IV (PolIV)  28.33 
 
 		 370 aa  109  8.000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.9387500000000003e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  27.83 
 
 		 365 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>