227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0023 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 1211 aa  2450    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2588  cytochrome c assembly protein  43.32 
 
 		 616 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2821  cytochrome c assembly protein  41.76 
 
 		 651 aa  432  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.846936  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1853  cytochrome c assembly protein  40.73 
 
 		 605 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1773  cytochrome c assembly protein  40.87 
 
 		 605 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00408104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2103  cytochrome c assembly protein  40.7 
 
 		 605 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387061  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4406  cytochrome c assembly protein  40.25 
 
 		 645 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1713  cytochrome c assembly protein  41.49 
 
 		 600 aa  393  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  30.62 
 
 		 883 aa  268  5.999999999999999e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1926  cytochrome c assembly protein  31.45 
 
 		 602 aa  234  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.457048  hitchhiker  0.00250068 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1712  hypothetical protein  34.57 
 
 		 386 aa  181  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2587  hypothetical protein  34.57 
 
 		 387 aa  177  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  23.84 
 
 		 1017 aa  173  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  24.15 
 
 		 1041 aa  172  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1852  hypothetical protein  33.83 
 
 		 392 aa  172  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1772  hypothetical protein  33.04 
 
 		 392 aa  172  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2104  hypothetical protein  33.83 
 
 		 392 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.131572  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2822  hypothetical protein  33.79 
 
 		 393 aa  160  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  25.13 
 
 		 791 aa  159  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  24.59 
 
 		 1076 aa  159  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  22.61 
 
 		 1081 aa  157  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  22.47 
 
 		 1081 aa  155  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  23.64 
 
 		 898 aa  153  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  22.78 
 
 		 1081 aa  152  5e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4405  hypothetical protein  34.59 
 
 		 391 aa  150  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.22864 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  23.92 
 
 		 1045 aa  150  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  24.52 
 
 		 889 aa  149  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  22.88 
 
 		 899 aa  148  7.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  23.74 
 
 		 1031 aa  146  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  23.26 
 
 		 901 aa  144  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.97 
 
 		 1054 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  24.27 
 
 		 1024 aa  142  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  25.45 
 
 		 749 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  24.59 
 
 		 1027 aa  132  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  22.43 
 
 		 873 aa  125  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  29.24 
 
 		 1074 aa  124  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  29.01 
 
 		 748 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  29.01 
 
 		 760 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  28.28 
 
 		 782 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1054 aa  109  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  31.35 
 
 		 304 aa  102  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  33.46 
 
 		 278 aa  101  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  29.96 
 
 		 276 aa  100  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.74 
 
 		 271 aa  97.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.66 
 
 		 283 aa  96.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30 
 
 		 321 aa  95.5  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  31.44 
 
 		 282 aa  94.7  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 		 394 aa  94.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  29.13 
 
 		 315 aa  93.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  31.06 
 
 		 285 aa  93.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  28.74 
 
 		 315 aa  92.8  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  30.77 
 
 		 283 aa  92.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.01 
 
 		 282 aa  92  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.36 
 
 		 271 aa  92  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  32.16 
 
 		 381 aa  91.7  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  32.03 
 
 		 284 aa  90.9  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  28.83 
 
 		 309 aa  90.9  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  30.8 
 
 		 304 aa  89.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.88 
 
 		 284 aa  89.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  29.24 
 
 		 309 aa  89.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.39 
 
 		 282 aa  89.4  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.91 
 
 		 283 aa  89.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  30.57 
 
 		 271 aa  89  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.69 
 
 		 405 aa  88.6  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.7 
 
 		 258 aa  88.6  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  32.09 
 
 		 395 aa  87.4  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  32.74 
 
 		 283 aa  87.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.72 
 
 		 396 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  30.7 
 
 		 278 aa  87  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 		 395 aa  86.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  31.17 
 
 		 284 aa  86.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  29.7 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.03 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  30.74 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  33.33 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  30.03 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.11 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  32.57 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  29.84 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.48 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  30.74 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  32.11 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  28.11 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.03 
 
 		 396 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.96 
 
 		 282 aa  84.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  30.03 
 
 		 396 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.63 
 
 		 395 aa  84.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  30.03 
 
 		 396 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  30.74 
 
 		 396 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  30.74 
 
 		 396 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  28.76 
 
 		 391 aa  84  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  30.74 
 
 		 396 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  30.74 
 
 		 396 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  30.74 
 
 		 396 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  28.63 
 
 		 283 aa  84  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  30.73 
 
 		 401 aa  83.2  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  30.74 
 
 		 379 aa  83.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  30.35 
 
 		 271 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.63 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  30.74 
 
 		 396 aa  83.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>