More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2985 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  93.16 
 
 		 395 aa  727    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  100 
 
 		 395 aa  779    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  93.16 
 
 		 395 aa  727    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  81.63 
 
 		 401 aa  628  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  78.88 
 
 		 407 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  74.08 
 
 		 401 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  73.26 
 
 		 403 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  74.27 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  73.47 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  72.42 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  73.21 
 
 		 405 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  73.21 
 
 		 396 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  70.32 
 
 		 396 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  73.21 
 
 		 396 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  70.07 
 
 		 396 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  70.07 
 
 		 408 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  69.62 
 
 		 396 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  69.83 
 
 		 396 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  70.07 
 
 		 396 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  70.07 
 
 		 396 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  73.21 
 
 		 396 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  70.07 
 
 		 396 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  72.94 
 
 		 396 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  69.74 
 
 		 379 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  61.98 
 
 		 446 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  70.08 
 
 		 381 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  61.02 
 
 		 444 aa  498  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  60.79 
 
 		 444 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  60.95 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  62.36 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  67.2 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  60.83 
 
 		 438 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  59.91 
 
 		 465 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  60.14 
 
 		 442 aa  474  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  56.49 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  55.53 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.33 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  53.69 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  54.71 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0434  putative cytochrome c asssembly protein  55.92 
 
 		 473 aa  310  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.105274  normal  0.205387 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.44 
 
 		 395 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  48.19 
 
 		 352 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  45.42 
 
 		 284 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.86 
 
 		 282 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.81 
 
 		 282 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.71 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.89 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  43.01 
 
 		 284 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  43.75 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  43.01 
 
 		 284 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  43.97 
 
 		 285 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  41.6 
 
 		 278 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  42.65 
 
 		 283 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  42.97 
 
 		 271 aa  193  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.13 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  46.43 
 
 		 271 aa  190  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.43 
 
 		 271 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  41.18 
 
 		 276 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  43.64 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.82 
 
 		 271 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  43.24 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  38.89 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.24 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.64 
 
 		 284 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  42.66 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.14 
 
 		 283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.1 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  39.27 
 
 		 255 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  37.55 
 
 		 283 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.86 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  37.99 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  36.47 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  36.08 
 
 		 304 aa  150  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  35.46 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  33.33 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.77 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  32 
 
 		 325 aa  143  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  36.05 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.46 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  34.73 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.48 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  36.47 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.41 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.03 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  38.03 
 
 		 397 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.9 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.7 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.78 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  36.67 
 
 		 268 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  34.51 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  38.96 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  34.6 
 
 		 318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  38.5 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  39.39 
 
 		 330 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  35.18 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  36.13 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  35.54 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  34.87 
 
 		 312 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.49 
 
 		 358 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>