255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1116 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  47.73 
 
 
1027 aa  939    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  62.73 
 
 
1081 aa  1399    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  61.9 
 
 
1081 aa  1387    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  44.37 
 
 
1017 aa  900    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  38.71 
 
 
1041 aa  717    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  44.29 
 
 
1045 aa  920    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  48.1 
 
 
1031 aa  932    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  47.84 
 
 
1024 aa  993    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  100 
 
 
1076 aa  2196    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  62.64 
 
 
1081 aa  1402    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  46.7 
 
 
901 aa  634  1e-180  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  33.82 
 
 
1054 aa  588  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  34.27 
 
 
1074 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  43.49 
 
 
899 aa  581  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.15 
 
 
1054 aa  581  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  44.05 
 
 
898 aa  548  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  41.68 
 
 
791 aa  537  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  37.48 
 
 
889 aa  505  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  38.85 
 
 
873 aa  466  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  27.79 
 
 
749 aa  225  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  27.34 
 
 
782 aa  225  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  27.56 
 
 
748 aa  225  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  27.61 
 
 
760 aa  214  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  24.59 
 
 
1211 aa  159  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  34.31 
 
 
283 aa  150  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  36.55 
 
 
283 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  35.86 
 
 
304 aa  143  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  35.32 
 
 
315 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  35.32 
 
 
315 aa  140  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  33.68 
 
 
309 aa  137  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  34.2 
 
 
309 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  33.61 
 
 
276 aa  137  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  33.68 
 
 
309 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  34.63 
 
 
318 aa  135  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  35.41 
 
 
304 aa  134  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  34.55 
 
 
285 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  34.48 
 
 
312 aa  134  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  35.22 
 
 
284 aa  132  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  36.99 
 
 
284 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  33.33 
 
 
278 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  33.93 
 
 
295 aa  129  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  36.73 
 
 
283 aa  128  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  33.94 
 
 
325 aa  128  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  36.86 
 
 
278 aa  128  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  33.56 
 
 
284 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.34 
 
 
341 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.34 
 
 
341 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  32.08 
 
 
352 aa  126  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.25 
 
 
282 aa  125  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2588  cytochrome c assembly protein  29.45 
 
 
616 aa  124  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463531  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.29 
 
 
284 aa  124  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  35.25 
 
 
282 aa  124  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.05 
 
 
321 aa  124  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.07 
 
 
283 aa  122  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  32.02 
 
 
320 aa  122  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.06 
 
 
271 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 
349 aa  121  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  35.87 
 
 
255 aa  121  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.36 
 
 
339 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.95 
 
 
350 aa  120  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.47 
 
 
323 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.62 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  34.5 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  33.06 
 
 
327 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  30.99 
 
 
351 aa  118  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.98 
 
 
282 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.58 
 
 
358 aa  117  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  32.6 
 
 
395 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.69 
 
 
282 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1713  cytochrome c assembly protein  25 
 
 
600 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628224  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.08 
 
 
395 aa  117  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  29.73 
 
 
351 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.61 
 
 
272 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2821  cytochrome c assembly protein  31.15 
 
 
651 aa  115  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.846936  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  30.43 
 
 
391 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1773  cytochrome c assembly protein  30.67 
 
 
605 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00408104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2103  cytochrome c assembly protein  30.67 
 
 
605 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1853  cytochrome c assembly protein  29.78 
 
 
605 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  31.82 
 
 
330 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  33.47 
 
 
325 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  30.67 
 
 
329 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  31.35 
 
 
379 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.9 
 
 
283 aa  113  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  35.17 
 
 
407 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.16 
 
 
405 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  30.93 
 
 
271 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  32.02 
 
 
378 aa  112  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.62 
 
 
271 aa  112  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.62 
 
 
357 aa  111  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  34.09 
 
 
271 aa  111  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.02 
 
 
271 aa  110  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4406  cytochrome c assembly protein  28.3 
 
 
645 aa  110  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  30.8 
 
 
327 aa  110  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  32.64 
 
 
395 aa  109  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.68 
 
 
394 aa  109  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  31.06 
 
 
324 aa  109  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  32.47 
 
 
271 aa  109  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  34.32 
 
 
401 aa  108  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  30.43 
 
 
334 aa  109  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  30.43 
 
 
334 aa  109  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.034343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>