40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2587 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2587  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  792    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2822  hypothetical protein  62.3 
 
 		 393 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2104  hypothetical protein  48.38 
 
 		 392 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.131572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1772  hypothetical protein  48.38 
 
 		 392 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1852  hypothetical protein  48.11 
 
 		 392 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4405  hypothetical protein  53.14 
 
 		 391 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.22864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1712  hypothetical protein  42.51 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  34.68 
 
 		 1211 aa  196  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  31.36 
 
 		 1017 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  32.98 
 
 		 791 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1927  hypothetical protein  38.3 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.595624  normal  0.0101264 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.97 
 
 		 1081 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.97 
 
 		 1081 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  35.87 
 
 		 901 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  27.12 
 
 		 1081 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  31.2 
 
 		 883 aa  63.2  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  29.71 
 
 		 1031 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  30.19 
 
 		 749 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  30.19 
 
 		 748 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  23.78 
 
 		 898 aa  60.1  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  30.19 
 
 		 760 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  21.94 
 
 		 873 aa  59.7  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  31.91 
 
 		 1076 aa  59.7  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  29.35 
 
 		 899 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  31.52 
 
 		 1041 aa  57.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  32.73 
 
 		 1027 aa  56.6  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.96 
 
 		 1054 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  26.55 
 
 		 782 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  25.19 
 
 		 1045 aa  55.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  28 
 
 		 1054 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  26.97 
 
 		 1074 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  36 
 
 		 1024 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  24 
 
 		 889 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1132  ResB family protein  33.33 
 
 		 722 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  38.24 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2204  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  33.33 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  29.17 
 
 		 742 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  35.62 
 
 		 614 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  35.62 
 
 		 614 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  33.33 
 
 		 727 aa  43.1  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>