134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0665 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  49.79 
 
 
700 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  49.33 
 
 
733 aa  683    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  48.34 
 
 
718 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  46.47 
 
 
738 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  47.53 
 
 
719 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1132  ResB family protein  64.68 
 
 
722 aa  933    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  80.19 
 
 
739 aa  1219    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  47.06 
 
 
740 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  50.87 
 
 
750 aa  698    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  47.35 
 
 
737 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  46.67 
 
 
740 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  47.35 
 
 
737 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  66.8 
 
 
732 aa  964    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  100 
 
 
742 aa  1522    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  66.62 
 
 
717 aa  962    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  48.34 
 
 
718 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  61.42 
 
 
724 aa  903    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  56.32 
 
 
679 aa  779    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  48.34 
 
 
718 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  48.29 
 
 
725 aa  675    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  48.34 
 
 
718 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  48.29 
 
 
725 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  66.62 
 
 
717 aa  961    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  65.21 
 
 
727 aa  944    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  48.23 
 
 
738 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  47.21 
 
 
737 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  46.67 
 
 
738 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  47.81 
 
 
741 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  46.27 
 
 
737 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  50.2 
 
 
734 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  50 
 
 
734 aa  674    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  41.42 
 
 
670 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  40.95 
 
 
694 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  37.74 
 
 
660 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  32.61 
 
 
679 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  31.28 
 
 
678 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  32.18 
 
 
664 aa  342  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  30.32 
 
 
700 aa  334  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  32.05 
 
 
701 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  35.02 
 
 
614 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  35.02 
 
 
614 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  22.55 
 
 
457 aa  103  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  25.41 
 
 
454 aa  97.8  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.55 
 
 
428 aa  89.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.67 
 
 
429 aa  89.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  27.91 
 
 
454 aa  88.6  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  24.61 
 
 
535 aa  85.1  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  25.17 
 
 
452 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  23.99 
 
 
452 aa  84  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  27.05 
 
 
459 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.65 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.32 
 
 
428 aa  83.2  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.57 
 
 
428 aa  82  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  25.54 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  25.54 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  21.62 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  25.99 
 
 
457 aa  79  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  24.6 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  24.29 
 
 
511 aa  78.2  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  24.31 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  23.76 
 
 
458 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.68 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  20.33 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  24.33 
 
 
452 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  26.3 
 
 
461 aa  72  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  24.74 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  23.27 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.35 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.18 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  25.52 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  23.75 
 
 
461 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  23.46 
 
 
540 aa  65.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  22.58 
 
 
553 aa  64.7  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  23.82 
 
 
456 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  24.12 
 
 
550 aa  62  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  23.63 
 
 
538 aa  61.6  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  23.63 
 
 
541 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  23.08 
 
 
541 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  26.77 
 
 
529 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  24.02 
 
 
395 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  29.33 
 
 
782 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  23.08 
 
 
541 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  22.53 
 
 
541 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  23.6 
 
 
548 aa  58.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  27.71 
 
 
336 aa  58.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  27.13 
 
 
554 aa  58.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  22.53 
 
 
541 aa  58.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  22.53 
 
 
541 aa  58.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  22.53 
 
 
541 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  22.53 
 
 
541 aa  57.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  22.53 
 
 
541 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  20.62 
 
 
542 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  20.83 
 
 
522 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  22.62 
 
 
484 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  25.08 
 
 
448 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  24.34 
 
 
539 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  23.58 
 
 
518 aa  54.7  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2204  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.41 
 
 
432 aa  54.3  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  38.1 
 
 
749 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  23.32 
 
 
565 aa  52.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>