280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1875 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  100 
 
 		 873 aa  1755    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  45.29 
 
 		 898 aa  723    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  40.22 
 
 		 901 aa  617  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  38.56 
 
 		 899 aa  616  1e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  39.75 
 
 		 1045 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  35.14 
 
 		 889 aa  541  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  41.53 
 
 		 1017 aa  538  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  42.25 
 
 		 1031 aa  534  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  41.1 
 
 		 1024 aa  526  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  42.13 
 
 		 1027 aa  521  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  36.94 
 
 		 1081 aa  491  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  37.56 
 
 		 1081 aa  488  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  37.44 
 
 		 1081 aa  488  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  38.53 
 
 		 1076 aa  484  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  39.91 
 
 		 791 aa  479  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  37.71 
 
 		 1041 aa  477  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  35.92 
 
 		 1054 aa  460  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  34.44 
 
 		 1074 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.84 
 
 		 1054 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  26.61 
 
 		 748 aa  200  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  26.31 
 
 		 749 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  26.53 
 
 		 782 aa  193  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  25.77 
 
 		 760 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  38.34 
 
 		 284 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  38.02 
 
 		 283 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  37.27 
 
 		 283 aa  129  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.33 
 
 		 282 aa  127  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.95 
 
 		 283 aa  127  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  23.58 
 
 		 1211 aa  127  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  30.26 
 
 		 283 aa  126  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.26 
 
 		 323 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  38.94 
 
 		 278 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  35.02 
 
 		 329 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.92 
 
 		 330 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  37.39 
 
 		 284 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  32.48 
 
 		 309 aa  122  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  35.69 
 
 		 276 aa  121  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  35.71 
 
 		 284 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  36.96 
 
 		 271 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  30.99 
 
 		 309 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  36.76 
 
 		 282 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1713  cytochrome c assembly protein  25.78 
 
 		 600 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  36.21 
 
 		 271 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  32.17 
 
 		 312 aa  117  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  23.65 
 
 		 883 aa  117  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.61 
 
 		 401 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  36.61 
 
 		 403 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.61 
 
 		 282 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.47 
 
 		 284 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  32.29 
 
 		 285 aa  114  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.04 
 
 		 405 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.59 
 
 		 282 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.51 
 
 		 339 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  33.33 
 
 		 278 aa  114  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 		 271 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.8 
 
 		 357 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1853  cytochrome c assembly protein  25.32 
 
 		 605 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  35.59 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  33.02 
 
 		 309 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  35.59 
 
 		 396 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  35.59 
 
 		 396 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  35.59 
 
 		 396 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1773  cytochrome c assembly protein  25.61 
 
 		 605 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00408104  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  35.59 
 
 		 396 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  35.59 
 
 		 396 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  35.59 
 
 		 396 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  36.05 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  32.43 
 
 		 320 aa  111  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  35.59 
 
 		 396 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.19 
 
 		 321 aa  111  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  32.08 
 
 		 330 aa  111  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.91 
 
 		 271 aa  111  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  34.68 
 
 		 396 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.68 
 
 		 396 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2103  cytochrome c assembly protein  25.3 
 
 		 605 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  33.48 
 
 		 395 aa  110  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  34.68 
 
 		 396 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 325 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  33.7 
 
 		 315 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.19 
 
 		 271 aa  110  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.23 
 
 		 405 aa  110  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.29 
 
 		 390 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  34.07 
 
 		 396 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.22 
 
 		 396 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  34.22 
 
 		 396 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.68 
 
 		 396 aa  110  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  34.68 
 
 		 401 aa  110  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  33.7 
 
 		 315 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  35.29 
 
 		 407 aa  109  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  33.99 
 
 		 318 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  33.94 
 
 		 379 aa  108  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  32.81 
 
 		 304 aa  107  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  29.46 
 
 		 327 aa  107  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  28.29 
 
 		 326 aa  106  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  28.29 
 
 		 326 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  28.29 
 
 		 326 aa  106  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  32.88 
 
 		 395 aa  105  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  28.29 
 
 		 326 aa  105  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.43 
 
 		 395 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.43 
 
 		 395 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>