263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2071 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 883 aa  1783    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  30.62 
 
 		 1211 aa  268  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2103  cytochrome c assembly protein  32.87 
 
 		 605 aa  260  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1853  cytochrome c assembly protein  32.81 
 
 		 605 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1773  cytochrome c assembly protein  32.87 
 
 		 605 aa  258  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00408104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4406  cytochrome c assembly protein  34.02 
 
 		 645 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1713  cytochrome c assembly protein  32.62 
 
 		 600 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2821  cytochrome c assembly protein  29.69 
 
 		 651 aa  213  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.846936  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2588  cytochrome c assembly protein  40 
 
 		 616 aa  188  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  25.3 
 
 		 1017 aa  154  7e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  26.93 
 
 		 1045 aa  147  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1926  cytochrome c assembly protein  38.86 
 
 		 602 aa  145  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.457048  hitchhiker  0.00250068 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  24.84 
 
 		 889 aa  143  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  25.12 
 
 		 791 aa  134  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  23.57 
 
 		 1074 aa  131  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1054 aa  131  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.54 
 
 		 1054 aa  125  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  24.73 
 
 		 901 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  23.78 
 
 		 782 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0916  cytochrome c assembly protein  23.63 
 
 		 1041 aa  120  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307598  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  23.69 
 
 		 1081 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  22.25 
 
 		 1081 aa  118  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  23.59 
 
 		 1081 aa  118  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  24.5 
 
 		 898 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  23.96 
 
 		 899 aa  115  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  23.17 
 
 		 1024 aa  115  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  24.01 
 
 		 873 aa  113  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  32.42 
 
 		 278 aa  106  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  32.02 
 
 		 304 aa  101  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  34.43 
 
 		 327 aa  99.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  33.6 
 
 		 334 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  33.6 
 
 		 334 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  33.6 
 
 		 334 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  34.69 
 
 		 324 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  32.74 
 
 		 283 aa  96.3  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  28.91 
 
 		 749 aa  96.3  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  33.33 
 
 		 324 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  33.47 
 
 		 328 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.36 
 
 		 394 aa  94.7  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  34 
 
 		 326 aa  94.7  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  22.25 
 
 		 1027 aa  94.7  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  33.2 
 
 		 326 aa  94.7  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  31.74 
 
 		 284 aa  94.7  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  33.2 
 
 		 326 aa  94.7  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  33.2 
 
 		 326 aa  94.7  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.56 
 
 		 283 aa  94.4  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.59 
 
 		 390 aa  93.2  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  31.86 
 
 		 284 aa  91.3  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  27.89 
 
 		 760 aa  90.9  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  31.64 
 
 		 304 aa  90.5  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.26 
 
 		 309 aa  90.5  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  31.47 
 
 		 276 aa  90.1  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  27.89 
 
 		 748 aa  90.9  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  31.88 
 
 		 283 aa  89.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.46 
 
 		 405 aa  89.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.49 
 
 		 321 aa  89.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  29.18 
 
 		 1076 aa  89.4  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  32.74 
 
 		 282 aa  88.6  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  31.42 
 
 		 284 aa  87.8  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  31.46 
 
 		 379 aa  87  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  29.73 
 
 		 391 aa  87  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  31.27 
 
 		 318 aa  87  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  30.41 
 
 		 395 aa  87  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.28 
 
 		 454 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.4 
 
 		 282 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  31.13 
 
 		 381 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.49 
 
 		 282 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  31.13 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.13 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  30.27 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.94 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  31.13 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.21 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  29.44 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.13 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  33.79 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.13 
 
 		 396 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  29.89 
 
 		 315 aa  84  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  29.66 
 
 		 309 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  31.13 
 
 		 396 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  31.13 
 
 		 396 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.17 
 
 		 283 aa  83.2  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  32.88 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  29.52 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  30.41 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  30.41 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  30.08 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  30.41 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  30.41 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  30.41 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  30.41 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  30.41 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.74 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  29.28 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.23 
 
 		 361 aa  80.5  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.91 
 
 		 401 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  30.41 
 
 		 396 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.05 
 
 		 395 aa  80.1  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  28.91 
 
 		 403 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>